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zhalaga

新虫 (初入文坛)

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[交流] 使用Arlequin软件的问题

请教一个使用Arlequin软件的问题，如果想通过STR的等位基因频率计算不同人群间的差异度“population differentiation” 可以用下面的example吗？
[Profile]

      Title="Y chromosome microsatellite data scored as allele frequencies"

      #Reference:
      #       Skorecki et al. (1997) Y chromosome of Jewish priests. Nature 385:32.

      NbSamples=5
      DataType=FREQUENCY
      GenotypicData=1
      LocusSeparator=' '
      MissingData="?"
      Frequency= REL

[Data]

#Commented microsatellite haplotype definition. Not necessary here

#       [[HaplotypeDefinition]]
#
#             HaplListName="Yap-DYS19 haplotypes on Y chromosome"
#                HaplList={
#                      1 Yap- A
#                      2 Yap- B
#                      3 Yap- C
#                      4 Yap- D
#                      5 Yap- E
#                      6 Yap+ All
#             }

[[Samples]]

      SampleName="changsha"
      SampleSize=184
      SampleData= {
            1       0.001
            2       0.112
            3       0.27
            4    0.055
            5    0.483
            6    0.036
            7    0.041
            8    0.002
      }

      SampleName="shanghai"
      SampleSize=189
      SampleData= {
            1       0
            2       0.0993
            3       0.2165
            4    0.0511
            5    0.5215
            6    0.0326
            7    0.028
            8    0.0011
      }

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1楼 2012-12-30 13:44:38

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userhung

禁虫 (文学泰斗)

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★ ★ ★
zhalaga(金币+1): 谢谢参与
看天: 金币+2 2012-12-30 22:15:52

http://www.cqvip.com/QK/96140X/200406/12078881.html
http://cpfd.cnki.com.cn/Article/CPFDTOTAL-ZGFW200400001004.htm
http://www.cnki.com.cn/Article/CJFDTotal-FUAN200406004.htm

2楼2012-12-30 13:50:21

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zhalaga

新虫 (初入文坛)

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没有丝毫帮助。。。。。

7楼2012-12-30 21:52:09

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凤城之女

新虫 (初入文坛)

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★
zhalaga(金币+1): 谢谢参与

同问楼主这样行不行啊？。。我看example里就它比较像~~

10楼2013-10-26 09:21:29

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简单回复

小衣冰滢3楼

2012-12-30 14:07 回复

zhalaga(金币+1): 谢谢参与

ljqpyk4楼

2012-12-30 14:14 回复

zhalaga(金币+1): 谢谢参与

prry20085楼

2012-12-30 14:16 回复

zhalaga(金币+1): 谢谢参与

su-b086楼

2012-12-30 15:00 回复

zhalaga(金币+1): 谢谢参与

neu2348楼

2012-12-31 10:01 回复

zhalaga(金币+1): 谢谢参与

piaoyingaza9楼

2013-01-02 14:59 回复

zhalaga(金币+1): 谢谢参与

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