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使用Arlequin软件的问题
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请教一个使用Arlequin软件的问题，如果想通过STR的等位基因频率计算不同人群间的差异度“population differentiation” 可以用下面的example吗？ [Profile] Title="Y chromosome microsatellite data scored as allele frequencies" #Reference: # Skorecki et al. (1997) Y chromosome of Jewish priests. Nature 385:32. NbSamples=5 DataType=FREQUENCY GenotypicData=1 LocusSeparator=' ' MissingData="?" Frequency= REL [Data] #Commented microsatellite haplotype definition. Not necessary here # [[HaplotypeDefinition]] # # HaplListName="Yap-DYS19 haplotypes on Y chromosome" # HaplList={ # 1 Yap- A # 2 Yap- B # 3 Yap- C # 4 Yap- D # 5 Yap- E # 6 Yap+ All # } [[Samples]] SampleName="changsha" SampleSize=184 SampleData= { 1 0.001 2 0.112 3 0.27 4 0.055 5 0.483 6 0.036 7 0.041 8 0.002 } SampleName="shanghai" SampleSize=189 SampleData= { 1 0 2 0.0993 3 0.2165 4 0.0511 5 0.5215 6 0.0326 7 0.028 8 0.0011 } |
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 Arlequin |
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看天: 金币+2 2012-12-30 22:15:52
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http://www.cqvip.com/QK/96140X/200406/12078881.html http://cpfd.cnki.com.cn/Article/CPFDTOTAL-ZGFW200400001004.htm http://www.cnki.com.cn/Article/CJFDTotal-FUAN200406004.htm |
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小衣冰滢3楼
2012-12-30 14:07
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