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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 使用Arlequin软件的问题
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zhalaga

新虫 (初入文坛)

[交流] 使用Arlequin软件的问题

请教一个使用Arlequin软件的问题，如果想通过STR的等位基因频率计算不同人群间的差异度“population differentiation” 可以用下面的example吗？
[Profile]

        Title="Y chromosome microsatellite data scored as allele frequencies"

        #Reference:
        #        Skorecki et al. (1997) Y chromosome of Jewish priests. Nature 385:32.
        
        NbSamples=5                 
        DataType=FREQUENCY                 
        GenotypicData=1
        LocusSeparator=' '            
        MissingData="?"        
        Frequency= REL

[Data]

#Commented microsatellite haplotype definition. Not necessary here

#        [[HaplotypeDefinition]]
#
#                HaplListName="Yap-DYS19 haplotypes on Y chromosome"
#                  HaplList={
#                        1 Yap- A
#                        2 Yap- B
#                        3 Yap- C
#                        4 Yap- D
#                        5 Yap- E
#                        6 Yap+ All               
#                }


[[Samples]]

        SampleName="changsha"
        SampleSize=184
        SampleData= {
                1        0.001
                2        0.112
                3        0.27
                4       0.055
                5       0.483
                6       0.036
                7       0.041
                8       0.002
        }

        SampleName="shanghai"
        SampleSize=189
        SampleData= {
                1        0
                2        0.0993
                3        0.2165
                4       0.0511
                5       0.5215
                6       0.0326
                7       0.028
                8       0.0011
        }
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1楼 2012-12-30 13:44:38
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userhung

禁虫 (文学泰斗)
★ ★ ★
zhalaga(金币+1): 谢谢参与
看天: 金币+2 2012-12-30 22:15:52
http://www.cqvip.com/QK/96140X/200406/12078881.html
http://cpfd.cnki.com.cn/Article/CPFDTOTAL-ZGFW200400001004.htm
http://www.cnki.com.cn/Article/CJFDTotal-FUAN200406004.htm
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2楼2012-12-30 13:50:21
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zhalaga

新虫 (初入文坛)
没有丝毫帮助。。。。。
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7楼2012-12-30 21:52:09
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凤城之女

新虫 (初入文坛)
★
zhalaga(金币+1): 谢谢参与
同问楼主这样行不行啊？。。我看example里就它比较像~~
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10楼2013-10-26 09:21:29
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小衣冰滢3楼
2012-12-30 14:07   回复  
zhalaga(金币+1): 谢谢参与
ljqpyk4楼
2012-12-30 14:14   回复  
zhalaga(金币+1): 谢谢参与
prry20085楼
2012-12-30 14:16   回复  
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su-b086楼
2012-12-30 15:00   回复  
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neu2348楼
2012-12-31 10:01   回复  
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piaoyingaza9楼
2013-01-02 14:59   回复  
zhalaga(金币+1): 谢谢参与
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