24小时热门版块排行榜    

查看: 1633  |  回复: 9
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

zhalaga

新虫 (初入文坛)


[交流] 使用Arlequin软件的问题

请教一个使用Arlequin软件的问题,如果想通过STR的等位基因频率计算不同人群间的差异度“population differentiation” 可以用下面的example吗?
[Profile]

        Title="Y chromosome microsatellite data scored as allele frequencies"

        #Reference:
        #        Skorecki et al. (1997) Y chromosome of Jewish priests. Nature 385:32.
        
        NbSamples=5                 
        DataType=FREQUENCY                 
        GenotypicData=1
        LocusSeparator=' '            
        MissingData="?"        
        Frequency= REL

[Data]

#Commented microsatellite haplotype definition. Not necessary here

#        [[HaplotypeDefinition]]
#
#                HaplListName="Yap-DYS19 haplotypes on Y chromosome"
#                  HaplList={
#                        1 Yap- A
#                        2 Yap- B
#                        3 Yap- C
#                        4 Yap- D
#                        5 Yap- E
#                        6 Yap+ All               
#                }


[[Samples]]

        SampleName="changsha"
        SampleSize=184
        SampleData= {
                1        0.001
                2        0.112
                3        0.27
                4       0.055
                5       0.483
                6       0.036
                7       0.041
                8       0.002
        }

        SampleName="shanghai"
        SampleSize=189
        SampleData= {
                1        0
                2        0.0993
                3        0.2165
                4       0.0511
                5       0.5215
                6       0.0326
                7       0.028
                8       0.0011
        }
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

Arlequin

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

» 抢金币啦!回帖就可以得到:

查看全部散金贴

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhalaga

新虫 (初入文坛)


没有丝毫帮助。。。。。
7楼2012-12-30 21:52:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

userhung

禁虫 (文学泰斗)


2楼2012-12-30 13:50:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

凤城之女

新虫 (初入文坛)



zhalaga(金币+1): 谢谢参与
同问楼主这样行不行啊?。。我看example里就它比较像~~
10楼2013-10-26 09:21:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +26 yaoyewhu2008 2026-08-20 28/1400 2026-08-26 13:49 by zzuzxg
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
[基金申请] 系统查不到 +9 董八千 2026-08-26 9/450 2026-08-26 12:30 by yanmofang
[基金申请] 科研孤儿太难了 +21 我4大白菜 2026-08-20 22/1100 2026-08-26 11:29 by nlgza
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +22 koalala 2026-08-24 25/1250 2026-08-26 11:14 by dxcharlary
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +6 process2012 2026-08-23 8/400 2026-08-26 11:03 by zjlp
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +21 羊腰板 2026-08-21 24/1200 2026-08-26 07:20 by finnigan
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候,我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
[基金申请] 今日不放榜?网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +17 医学老男孩 2026-08-20 22/1100 2026-08-25 15:36 by 医学老男孩
[基金申请] 人气不行了 +11 fansofjerry 2026-08-21 11/550 2026-08-25 11:04 by 孤独的英雄6
[教师之家] 导师吐槽:我怎么摊上了这么个极品研究生! +3 苏东坡二世 2026-08-23 3/150 2026-08-25 10:35 by shisan1313
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +13 kulium 2026-08-21 16/800 2026-08-24 16:27 by superceng
[基金申请] 让我中一个面上吧! +13 大萍1987 2026-08-20 16/800 2026-08-24 10:23 by 太傻了
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 时间戳今天,20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧? +4 哈哈蛤? 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
信息提示
请填处理意见