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邓芳木虫 (小有名气)
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GMX运行出错
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做药物分子和蛋白的相互作用时，输入命令：grompp -f nvt.mdp -c em.gro -p topol.top -n index.ndx -o nvt.tpr时出错 Fatal error: Group Protein_DRG not found in indexfile. Maybe you have non-default goups in your mdp file, while not using the '-n' option of grompp. In that case use the '-n' option. 请各位大侠帮忙 |
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 Gromacs |
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邓芳
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3楼2012-12-21 08:43:58
【答案】应助回帖
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感谢参与，应助指数 +1
邓芳: 金币+5, ★有帮助 2012-12-21 18:28:28
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太简单了提示都给的很清楚： “Group Protein_DRG not found in indexfile.Maybe you have non-default goups in your mdp file, while not using the '-n' option of grompp. In that case use the '-n' option.” 在你的mdp文件中有个group “Protein_DRG ”。但是你的index.ndx 文件里面没有这个group 多读手册 |
2楼2012-12-20 20:15:39
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4楼2012-12-21 09:32:09
邓芳
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5楼2012-12-21 16:35:40