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若博特

铜虫 (初入文坛)

[求助] 关于Abinit结构优化的问题。。。。。

在用Abinit优化金红石的结构时,发现优化的收敛标准用这个参量调节tolmxf,但是l输出文件中这个值是和最大梯度作比较的(max grad (force/stress) = 6.2629E-04 > tolmxf= 5.0000E-05 ha/bohr (free atoms))。  而最大梯队来等于压力张量分量: sigma(1 1),sigma(2 2)和sigma(3 3)之和在除以三乘以100。但是优化时候发现最大梯度可以比较小,但是压力张量分量是比较大的(化成压力各个分量可以到达1Gpa),怎么办?怎样的参数能调节各个分量呢?
第二个问题:log文件中出现这样的警告语句应该怎样消除?
findmin : WARNING -
  The 2nd degree equation has no positive root (choice=4).
findmin : COMMENT -
  Will continue, since the new total energy is lower
  than the old. Take a larger step in the same direction.
   line minimization, algorithm   4
我是新人,对基础理论不是很懂,求助高手了。。。
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ljludwig

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
fzx2008: 金币+4, 谢谢交流! 2013-02-07 17:40:04
下一次要上传input file,只给warning帮助不大。

精度本身通常都不是问题,而是其他的设置。

优化acell的时候,用
optcell
dilatmx
ionmov
几个参数,最终如果收敛的花,就会把stress给relax掉;1GPa是肯定不对的。这么大的应力下什么都可能改变,比如direct band 变成indirect band gap.

具体意义可以查这里:
http://www.abinit.org/documentat ... .0/input_variables/

把LDA和GGA都做一遍,和实验值做个比较。
5楼2013-02-07 03:50:43
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月空星痕

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流, 2012-12-17 16:10:03
若博特: 金币+5, ★★★很有帮助, 设置nline确实消除了没有正根的现象。 2012-12-19 14:52:48
回答第二个问题:
1、增大nstep
2、改变nline,默认为4,可设置为5或者6
第一个问题要不要考虑多加几个收敛的参数?
天将降大任于斯人也,必先苦其心志,劳其筋骨,饿其体肤,
3楼2012-12-17 09:02:07
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若博特

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 益达木糖醇 at 2012-12-16 14:10:15

都是正式写手了别路过啊,敢不敢解答一下 啊。。。。。。
4楼2012-12-17 09:48:02
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tangosnow

木虫 (小有名气)

Abinit可以用toldfe, toldff, tolrff, tolvrs, tolwfr中的一个参数作为收敛标准,并且只能输入一个参数。
选择上述参数中的某一个,则这取决于你要收敛的对象,比如能量,比如能带结构。
6楼2013-02-08 02:40:00
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