应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 引物设计
71/1返回列表
查看: 811  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

竹影静亭

新虫 (初入文坛)

[求助] 引物设计

我要做染料法荧光定量，但是我用Primer设计，退货温度都很低，得分高的退货温度只有49度，只有一个温度上50的，但是与模版有错配，这应该怎么弄啊，刚学设计引物，请各位给予知道！先将基因序列上传，
回复此楼

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : 新建文本文档.txt
    • 2012-12-09 19:54:19, 1.48 K

» 猜你喜欢
1楼 2012-12-09 19:54:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
竹影静亭: 金币+10, ★有帮助 2012-12-12 16:55:55
不知道你想具体设计成什么样，你分析一下这一对看。扩增片段为218bp。
Forward: TACCCATCACGGACGACAATAC
Reverse: GGTCTTGACTATCCGCCATTTC
赞一下 回复此楼
2楼2012-12-10 03:10:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

竹影静亭

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by cicelyzh at 2012-12-10 03:10:25
不知道你想具体设计成什么样，你分析一下这一对看。扩增片段为218bp。
Forward: TACCCATCACGGACGACAATAC
Reverse: GGTCTTGACTATCCGCCATTTC

请问你是用什么软件找到的这对引物
赞一下 回复此楼
3楼2012-12-12 16:29:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 竹影静亭 at 2012-12-12 16:29:08
请问你是用什么软件找到的这对引物...

我直接用的online program “primer 3”（http://frodo.wi.mit.edu/）。再稍微修改一下参数。
赞一下 回复此楼
4楼2012-12-13 08:08:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cory0931

至尊木虫 (文坛精英)

巫山云
December 23, 2012
Produced by Primer Premier, PREMIER Biosoft International, Tel: 650.856.2703, Fax: 650.843.1250, www.PremierBiosoft.com
Primer Analysis Report Page: 1
Sequence: NewSequence
(Sense primer) 5' CGCTGTTCTCCTTGCTTA 3'
            3' (143) GCGACAAGAGGAACGAAT (160) 5'
(Anti-sense primer) 5' GTCGTCCGTGATGGGTAT 3'
                   3' (724) CAGCAGGCACTACCCATA (707) 5'
Properties:
Rating
100
100
100
Seq No
143
724
--
Length
18
18
582
Tm
[ ° C]
51.8
52.7
87.5
GC%
50.0
55.6
44.8
G
[kcals/mol]
-34.5
-34.3
--
Activity
[  g/OD]
36.2
32.6
--
Degeneracy
1
1
--
Ta Opt
[ ° C]
--
--
51.8
Sense
Anti-sense
Product
Secondary structures of sense primer:
No hairpins found
No dimers found
No false priming sites found
Secondary structures of anti-sense primer:
No hairpins found
No dimers found
No false priming sites found
Secondary structures of primer pair:
No Cross Dimers Found
赞一下 回复此楼
锤之千古
5楼2012-12-23 17:37:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cory0931

至尊木虫 (文坛精英)

巫山云
引用回帖:
5楼: Originally posted by cory0931 at 2012-12-23 17:37:15
December 23, 2012
Produced by Primer Premier, PREMIER Biosoft International, Tel: 650.856.2703, Fax: 650.843.1250, www.PremierBiosoft.com
Primer Analysis Report Page: 1
Sequence: NewSequence
(Sen ...

Primer5设计
上传两张得分为100的引物资料：
1 CGCTGTTCTCCTTGCTTA
   GTCGTCCGTGATGGGTAT
产物长度582bp；
2  CGCTGTTCTCCTTGCTTA
   CTTCTACTGCTGTTGTGGC
产物长度1362bp;
具体参数见附图；

100 No-1.JPG



100 No-2.JPG
赞一下 回复此楼
锤之千古
6楼2012-12-23 17:45:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

墨竹韵

金虫 (职业作家)
引用回帖:
6楼: Originally posted by cory0931 at 2012-12-23 17:45:21
Primer5设计
上传两张得分为100的引物资料：
1 CGCTGTTCTCCTTGCTTA
   GTCGTCCGTGATGGGTAT
产物长度582bp；
2  CGCTGTTCTCCTTGCTTA
   CTTCTACTGCTGTTGTGGC
产物长度1362bp;
具体参数见附图；

100 No-1.J ...

想问这种报告是从哪里导出来的呀
赞一下 回复此楼
7楼2021-12-28 20:31:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 竹影静亭 的主题更新
71/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 306求0703调剂一志愿华中师范 +6 纸鱼ly 2026-03-21 6/300 2026-03-23 12:08 by Iveryant
[考研] 333求调剂 +6 87639 2026-03-21 10/500 2026-03-23 10:41 by Iveryant
[考研] 070300，一志愿北航320求调剂 +3 Jerry0216 2026-03-22 5/250 2026-03-23 09:16 by 。。堂堂
[考研] 0703 调剂 +3 我可以上岸的对� 2026-03-16 6/300 2026-03-23 08:52 by 醉在风里
[考研] 311求调剂 +6 冬十三 2026-03-18 6/300 2026-03-22 20:18 by edmund7
[考研] 能源材料化学课题组招收硕士研究生8-10名 +5 脱颖而出 2026-03-16 17/850 2026-03-22 15:18 by 脱颖而出
[考研] 材料求调剂 +5 @taotao 2026-03-21 5/250 2026-03-21 20:55 by lbsjt
[考研] 求助 +5 梦里的无言 2026-03-21 6/300 2026-03-21 17:51 by 学员8dgXkO
[考研] 296求调剂 +4 www_q 2026-03-20 4/200 2026-03-21 17:26 by 学员8dgXkO
[基金申请] 学校已经提交到NSFC，还能修改吗？ 40+4 babangida 2026-03-19 9/450 2026-03-21 16:12 by babangida
[考研] 材料与化工（0856）304求 B区 调剂 +3 邱gl 2026-03-21 3/150 2026-03-21 13:47 by lature00
[考研] 一志愿中国石油大学（华东） 本科齐鲁工业大学 +3 石能伟 2026-03-17 3/150 2026-03-21 02:22 by JourneyLucky
[考研] 332求调剂 +4 ydfyh 2026-03-17 4/200 2026-03-21 02:20 by JourneyLucky
[考研] 265求调剂 +9 梁梁校校 2026-03-17 9/450 2026-03-21 02:17 by JourneyLucky
[考研] 304求调剂 +6 曼殊2266 2026-03-18 6/300 2026-03-21 00:32 by JourneyLucky
[考研] 南京大学化学376求调剂 +3 hisfailed 2026-03-19 6/300 2026-03-20 23:43 by hisfailed
[考研] 308求调剂 +3 阿姐阿姐家啊 2026-03-18 3/150 2026-03-20 23:24 by JourneyLucky
[考研] 330求调剂 +4 小材化本科 2026-03-18 4/200 2026-03-20 23:13 by JourneyLucky
[考研] 086500 325 求调剂 +3 领带小熊 2026-03-19 3/150 2026-03-20 18:38 by 尽舜尧1
[考研] 有没有道铁/土木的想调剂南林，给自己招师弟中～ +3 TqlXswl 2026-03-16 7/350 2026-03-17 15:23 by TqlXswl
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭