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竹影静亭

新虫 (初入文坛)

[求助] 引物设计

我要做染料法荧光定量，但是我用Primer设计，退货温度都很低，得分高的退货温度只有49度，只有一个温度上50的，但是与模版有错配，这应该怎么弄啊，刚学设计引物，请各位给予知道！先将基因序列上传，
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    • 2012-12-09 19:54:19, 1.48 K

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1楼 2012-12-09 19:54:30
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cory0931

至尊木虫 (文坛精英)

巫山云
引用回帖:
5楼: Originally posted by cory0931 at 2012-12-23 17:37:15
December 23, 2012
Produced by Primer Premier, PREMIER Biosoft International, Tel: 650.856.2703, Fax: 650.843.1250, www.PremierBiosoft.com
Primer Analysis Report Page: 1
Sequence: NewSequence
(Sen ...

Primer5设计
上传两张得分为100的引物资料：
1 CGCTGTTCTCCTTGCTTA
   GTCGTCCGTGATGGGTAT
产物长度582bp；
2  CGCTGTTCTCCTTGCTTA
   CTTCTACTGCTGTTGTGGC
产物长度1362bp;
具体参数见附图；

100 No-1.JPG



100 No-2.JPG
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锤之千古
6楼2012-12-23 17:45:21
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
竹影静亭: 金币+10, ★有帮助 2012-12-12 16:55:55
不知道你想具体设计成什么样，你分析一下这一对看。扩增片段为218bp。
Forward: TACCCATCACGGACGACAATAC
Reverse: GGTCTTGACTATCCGCCATTTC
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2楼2012-12-10 03:10:25
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竹影静亭

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by cicelyzh at 2012-12-10 03:10:25
不知道你想具体设计成什么样，你分析一下这一对看。扩增片段为218bp。
Forward: TACCCATCACGGACGACAATAC
Reverse: GGTCTTGACTATCCGCCATTTC

请问你是用什么软件找到的这对引物
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3楼2012-12-12 16:29:08
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 竹影静亭 at 2012-12-12 16:29:08
请问你是用什么软件找到的这对引物...

我直接用的online program “primer 3”（http://frodo.wi.mit.edu/）。再稍微修改一下参数。
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4楼2012-12-13 08:08:28
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