| 查看: 3171 | 回复: 16 | ||
[求助]
有关IRC分析验证过渡态的问题
|
||
|
我通常都用IRC分析验证过渡态的对错，但是也有人说IRC不是那么可靠，有以下几点疑问，希望大家给与解答啊 1. 你们用IRC分析验证过渡态吗 2. IRC错误 就是 err termination之类的，那我的过渡态一定错吗 有时觉得过渡态振动形式是正确的啊 3. IRC正常结束，但是只跑了两三个点 或者 跑完了但根本不是平滑曲线 有类似折线的 那过渡态也是错的吗 有木有知道的虫子呀 |
回复此楼» 猜你喜欢
全奖博士 英国利物浦大学 × 台湾清华大学 联合培养
已经有0人回复
-
寻博导
已经有13人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有255人回复
-
基金正文30页指的是报告正文还是整个申请书
已经有9人回复
-
哈尔滨工业大学（深圳）绿色化学团队招收2026年秋季入学博士生
已经有11人回复
-
澳大利亚昆士兰科技大学PhD博士奖学金
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 过渡态~qst3出错
已经有11人回复
- 可以验证科研之友是否靠谱的一个新问题？
已经有9人回复
- 关于金刚石结构最稳定的表面
已经有6人回复
- ts找到过渡态，可以把做irc两端的点提出来优化作为反应物和产物的稳定结构么？
已经有12人回复
- 寻找过渡态，IRC forward方向一直下降，reverse方向先上升后有下降
已经有8人回复
- 寻找过渡态，走IRC产物方向与反应物方向相反,如何寻找正确的过渡态？
已经有11人回复
- 关于IRC方向的问题
已经有14人回复
- 对irc得到的结构是否可以（or 需要）作进一步结构优化？
已经有7人回复
- 关于irc restart的一个问题
已经有5人回复
- QST2找到的过渡态，做出的IRC却不指向反应物，请问该怎么调节
已经有4人回复
- 溶剂效应和优化过渡态的问题
已经有10人回复
- 羟基进攻化合物的IRC分析 出错
已经有7人回复
- 计算的朋友快来帮忙，IRC扫描错误问题，急急急！
已经有11人回复
- 跑IRC遇到的问题
已经有8人回复
- 【求助】irc文件出错求助
已经有5人回复
- 【求助】qst2找到过渡态后 接着怎么办？用IRC验证吗？
已经有6人回复
- 【讨论】NEB寻找过渡态专题讨论
已经有49人回复
9楼2012-12-17 20:52:00
liuyy2009
新虫 (初入文坛)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 20.9
- 散金: 31
- 帖子: 32
- 在线: 22.5小时
- 虫号: 690019
- 注册: 2009-01-08
- 性别: MM
- 专业: 物理无机化学
2楼2012-12-06 10:52:15
3楼2012-12-06 23:07:29
jerry007
银虫 (小有名气)
- 应助: 4 (幼儿园)
- 金币: 226.9
- 散金: 132
- 帖子: 103
- 在线: 102.8小时
- 虫号: 1779525
- 注册: 2012-04-26
- 专业: 理论和计算化学
4楼2012-12-07 06:39:52
5楼2012-12-07 21:37:36
TheMatrix
铜虫 (正式写手)
- 应助: 3 (幼儿园)
- 金币: 5363.5
- 帖子: 397
- 在线: 67.9小时
- 虫号: 1889422
- 注册: 2012-07-12
- 性别: GG
- 专业: 药物分析
6楼2012-12-08 18:55:33
zhongshidaxt
金虫 (著名写手)
- 应助: 16 (小学生)
- 金币: 3154.8
- 散金: 350
- 红花: 2
- 帖子: 1636
- 在线: 221.5小时
- 虫号: 1886171
- 注册: 2012-07-10
- 性别: GG
- 专业: 化学反应工程
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
蓝云星: 金币+4, ★有帮助, 嗯 IRC还算可靠的 尽量都做IRC确认下吧 谢谢啦 2012-12-17 20:55:29
感谢参与，应助指数 +1
蓝云星: 金币+4, ★有帮助, 嗯 IRC还算可靠的 尽量都做IRC确认下吧 谢谢啦 2012-12-17 20:55:29
|
楼主你好： 我最近刚用IRC来确认较小反应体系的过渡态（过渡态由QST2获得），从我自己计算的例子来看，IRC还是靠谱的。 IRC计算错误的原因有很多。首先可能是你寻找得到的过渡态构型就是不对的。可把寻找到的过渡态做优化和频率分析，确认只有一个虚频的话一般没问题。然后错误的原因可由log文件中找到，然后可以再google和小木虫上查找原因。 只跑了两三个点就结束了，如果是正常结束的话可能是设置的步长太长，可以调整步长。另外，有折线的情况，个人感觉是在计算过程中不同点之间构型变化太大，导致体系能量出现非平缓变化的情况，这个要做具体分析了。 |
7楼2012-12-08 19:32:03
8楼2012-12-17 13:49:21
10楼2012-12-17 20:57:33
5