24小时热门版块排行榜    

查看: 3791  |  回复: 11

lingao

金虫 (小有名气)

[求助] 寻找过渡态,走IRC产物方向与反应物方向相反,如何寻找正确的过渡态?

在做一个氢转移的过渡态,用TS方法找到,看振动趋势是正确的,但是走IRC却奇怪的发现forward方向回到反应物中间体,而reverse方向却指向产物中间体,用QST3找到的过渡态,结构跟原来一样,请教大家,这样的情况下如何找到正确的过渡态?
回复此楼
耐得了寂寞,拥得住繁华。。。
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

yangyanwen9

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
lingao: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2013-05-30 09:16:56
IRC中的forward和reverse只是从TS出发向振动模式的两个“不同”方向寻找势能面上稳定点(中间体)。而且所谓反应物中间体和产物中间体是从研究者的角度上区分的,如果研究的是逆过程的话,产物中间体不就变成反应物中间体了么?如你所说过渡态振动模式正确而且连接是反应物和产物中间体,你的优化结果没有任何问题啊。
2楼2013-05-25 15:09:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yangyanwen9

银虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by lingao at 2013-05-30 09:21:36
如果分别走IRC,forward 关键词指向的一般是所做机理过程的产物结构,而reverse才是反应物结构方向吧...

没有这种事,只是指向不同的两个方向。放心
8楼2013-05-31 07:34:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lingao

金虫 (小有名气)

引用回帖:
10楼: Originally posted by wunan1989 at 2013-06-05 16:29:51
想问下,振动模式正确是什么情况?

这个就要看,在过渡态中,唯一的虚频振动方向是否是指向形成产物结构的方向

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

耐得了寂寞,拥得住繁华。。。
11楼2013-06-06 08:49:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

bj-925

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
lingao: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-05-30 09:18:36
没有问题的,很正常
3楼2013-05-27 13:39:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhaogaiyun

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
lingao: 金币+5, 有帮助, 感谢回复。。 2013-05-30 09:22:15
这就是准确结果呀,本来过渡态做IRC结果就应该是向前倒反应物,向后到产物
4楼2013-05-29 10:54:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lingao

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by yangyanwen9 at 2013-05-25 15:09:41
IRC中的forward和reverse只是从TS出发向振动模式的两个“不同”方向寻找势能面上稳定点(中间体)。而且所谓反应物中间体和产物中间体是从研究者的角度上区分的,如果研究的是逆过程的话,产物中间体不就变成反应物 ...

多谢指教,应该是这样子的,谢谢了。。
耐得了寂寞,拥得住繁华。。。
5楼2013-05-30 09:17:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lingao

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by bj-925 at 2013-05-27 13:39:41
没有问题的,很正常

谢谢。。。
耐得了寂寞,拥得住繁华。。。
6楼2013-05-30 09:18:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lingao

金虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by zhaogaiyun at 2013-05-29 10:54:25
这就是准确结果呀,本来过渡态做IRC结果就应该是向前倒反应物,向后到产物

如果分别走IRC,forward 关键词指向的一般是所做机理过程的产物结构,而reverse才是反应物结构方向吧
耐得了寂寞,拥得住繁华。。。
7楼2013-05-30 09:21:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wunan1989

铜虫 (初入文坛)

受教了,呵呵!
fighting!
9楼2013-06-05 16:28:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wunan1989

铜虫 (初入文坛)

想问下,振动模式正确是什么情况?
fighting!
10楼2013-06-05 16:29:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 lingao 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[博后之家] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 h4CP7TrQR8Lg 2026-08-22 3/150 2026-08-23 16:30 by lXgU0RvNTDC9
[论文投稿] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 DpSrDtM079iu 2026-08-22 3/150 2026-08-23 15:33 by KM5EcsNQRBPn
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 DpSrDtM079iu 2026-08-22 4/200 2026-08-23 15:30 by KM5EcsNQRBPn
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-21 5/250 2026-08-23 14:33 by KM5EcsNQRBPn
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-21 6/300 2026-08-23 14:21 by KM5EcsNQRBPn
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +3 process2012 2026-08-23 4/200 2026-08-23 12:54 by huixian257
[基金申请] 什么时候开奖? +9 CrisMessi 2026-08-18 10/500 2026-08-23 12:03 by 丶昵称占用
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-21 9/450 2026-08-23 10:44 by IXZuIJ2Q7OVy
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 DpSrDtM079iu 2026-08-22 5/250 2026-08-23 04:07 by OEbVnUOu01ol
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 7/350 2026-08-23 03:43 by OEbVnUOu01ol
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +7 且听虎啸 2026-08-17 8/400 2026-08-22 21:55 by 医学老男孩
[基金申请] filecode,4个jtjc了 +13 ziyangfang 2026-08-19 16/800 2026-08-22 17:08 by WH3796
[基金申请] 今日不放榜?网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +16 医学老男孩 2026-08-20 20/1000 2026-08-21 21:13 by Ldrop2023
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +7 angus9576 2026-08-17 12/600 2026-08-21 13:38 by weiyin
[基金申请] 我面上完蛋了 +7 且听虎啸 2026-08-20 8/400 2026-08-21 12:31 by 酷酷墨镜
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧? +4 哈哈蛤? 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
[基金申请] 估计是周四 +3 archvillain 2026-08-18 3/150 2026-08-21 01:48 by jnhyjjm
[基金申请] 朋友圈看到的 +6 wangzilk 2026-08-18 8/400 2026-08-19 10:55 by Haru815
[基金申请] 明天放榜? +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
信息提示
请填处理意见