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lingao

金虫 (小有名气)

[求助] 寻找过渡态,走IRC产物方向与反应物方向相反,如何寻找正确的过渡态?

在做一个氢转移的过渡态,用TS方法找到,看振动趋势是正确的,但是走IRC却奇怪的发现forward方向回到反应物中间体,而reverse方向却指向产物中间体,用QST3找到的过渡态,结构跟原来一样,请教大家,这样的情况下如何找到正确的过渡态?
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过渡态计算 催化与分子模拟

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耐得了寂寞,拥得住繁华。。。
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yangyanwen9

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
lingao: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2013-05-30 09:16:56
IRC中的forward和reverse只是从TS出发向振动模式的两个“不同”方向寻找势能面上稳定点(中间体)。而且所谓反应物中间体和产物中间体是从研究者的角度上区分的,如果研究的是逆过程的话,产物中间体不就变成反应物中间体了么?如你所说过渡态振动模式正确而且连接是反应物和产物中间体,你的优化结果没有任何问题啊。
2楼2013-05-25 15:09:41
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yangyanwen9

银虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by lingao at 2013-05-30 09:21:36
如果分别走IRC,forward 关键词指向的一般是所做机理过程的产物结构,而reverse才是反应物结构方向吧...

没有这种事,只是指向不同的两个方向。放心
8楼2013-05-31 07:34:11
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lingao

金虫 (小有名气)

引用回帖:
10楼: Originally posted by wunan1989 at 2013-06-05 16:29:51
想问下,振动模式正确是什么情况?

这个就要看,在过渡态中,唯一的虚频振动方向是否是指向形成产物结构的方向

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

耐得了寂寞,拥得住繁华。。。
11楼2013-06-06 08:49:35
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普通回帖

bj-925

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
lingao: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-05-30 09:18:36
没有问题的,很正常
3楼2013-05-27 13:39:41
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zhaogaiyun

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
lingao: 金币+5, 有帮助, 感谢回复。。 2013-05-30 09:22:15
这就是准确结果呀,本来过渡态做IRC结果就应该是向前倒反应物,向后到产物
4楼2013-05-29 10:54:25
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lingao

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by yangyanwen9 at 2013-05-25 15:09:41
IRC中的forward和reverse只是从TS出发向振动模式的两个“不同”方向寻找势能面上稳定点(中间体)。而且所谓反应物中间体和产物中间体是从研究者的角度上区分的,如果研究的是逆过程的话,产物中间体不就变成反应物 ...

多谢指教,应该是这样子的,谢谢了。。
耐得了寂寞,拥得住繁华。。。
5楼2013-05-30 09:17:50
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lingao

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by bj-925 at 2013-05-27 13:39:41
没有问题的,很正常

谢谢。。。
耐得了寂寞,拥得住繁华。。。
6楼2013-05-30 09:18:30
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lingao

金虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by zhaogaiyun at 2013-05-29 10:54:25
这就是准确结果呀,本来过渡态做IRC结果就应该是向前倒反应物,向后到产物

如果分别走IRC,forward 关键词指向的一般是所做机理过程的产物结构,而reverse才是反应物结构方向吧
耐得了寂寞,拥得住繁华。。。
7楼2013-05-30 09:21:36
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wunan1989

铜虫 (初入文坛)

受教了,呵呵!
fighting!
9楼2013-06-05 16:28:32
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wunan1989

铜虫 (初入文坛)

想问下,振动模式正确是什么情况?
fighting!
10楼2013-06-05 16:29:51
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