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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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ldzh0531

木虫 (小有名气)

[求助] 溶剂效应和优化过渡态的问题

溶剂效应、温度等是优化结束后加还是跟优化一起呢?另外,用qst寻找过渡态的时候,要先优化反应物和产物(反应物和产物不只一种,要先优化他们的复合物)。如果优化的反应物和产物复合物的结构不是能量最低点而是local minimum还能不能做qst的过渡态寻找呢?只是寻找过渡态。我的意思是把反应物—过渡态—产物看成一个单独的反应,只计算他们的相对能量可不可以?
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zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT

★ ★ ★
gmy1990(金币+3): 2011-12-30 19:30:50
引用回帖:
6楼: Originally posted by ldzh0531 at 2011-12-30 11:11:07:
优化与温度无关,可是与能量有关。都说要使反应进行要加热到多少度,做单点的时候难道不用考虑温度吗?

能量这个词,太泛泛了。。你要清晰能量概念的范畴。。
比如说,分子内能、焓、自由能都是能量。
计算分子内能一般包括:平动、转动、振动、电子势能、电子动能、核势能等,
SCF自洽的,仅仅是电子势能这一部分,它仅仅取决于电子在核外的排布方式,此项与温度无关。而opt优化的就是找这个能量的最低点,因此,opt与温度无关。
与温度有关的,是平动、转动、振动项,其中平动项还与压力有关。这些称之为热力学能。
所以,普通的opt,给出的只是电子能,就是E(SCF)这一项。
计算频率时,给出温度、压力,才能算出热力学项,同时可以算出零点能,做了校正之后,才可以给出焓、自由能等。。
单点算,如果不做频率分析,得到的依然仅仅是E(SCF),此项与温度无关。
一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭,其实这是修养不足学识浅薄的一种体现,也是可恶的偏执和愚蠢的自以
7楼2011-12-30 11:25:01
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普通回帖

xiongb123456

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
ldzh0531(金币+1): 2011-12-11 20:01:15
我来回答一下第一个问题哈
溶剂效应 一般是优化结束后加的
计算一般不在溶剂化条件下算 都是气相优化 液相算个单点就可以了

其他问题 别人回答你吧 我不太熟 没做过不同温度的
2楼2011-12-10 20:27:36
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ldzh0531

木虫 (小有名气)

再问个问题,opt=ts或qst找到的过渡态都是能量最低点的吗?如果不是,该选哪一个。我试着两种方法都计算同一个过渡态,得到的能量不一样
3楼2011-12-27 18:28:45
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ssy_4222

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by ldzh0531 at 2011-12-27 18:28:45:
再问个问题,opt=ts或qst找到的过渡态都是能量最低点的吗?如果不是,该选哪一个。我试着两种方法都计算同一个过渡态,得到的能量不一样

同问,我也不懂,求普及
上善若水
4楼2011-12-27 21:50:14
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zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
ldzh0531(金币+3): ★★★很有帮助 2011-12-28 15:50:11
ldzh0531(金币+2): ★★★很有帮助 2011-12-30 13:09:32
ldzh0531(金币+1): 2012-01-04 11:55:59
ldzh0531(金币+1): ★★★★★最佳答案 2012-03-09 23:39:50
1、优化,是寻找电子能量的最小点,也就是找E(SCF)的最小点,该点于温度无关;
2、按理说,在溶剂中应该重新优化,但目前的溶剂化模型也非常粗糙,重新优化的也未必对,大家就都用气相优化的结果,直接在溶剂环境下做单点算,这应该算是睁一只眼闭一只眼吧。没办法,溶剂化模型太差。。。
3、过渡态理论只对基元反应适用。如果还有反应前期络合物,那就得从前期络合物入手。
4、无论QST还是TS找到的过渡态,都未必是真的,要跑IRC验证的。。如果都能验证成功,那自然是能垒最低的那个才是过渡态。。
一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭,其实这是修养不足学识浅薄的一种体现,也是可恶的偏执和愚蠢的自以
5楼2011-12-28 12:40:49
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ldzh0531

木虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by zhangmt at 2011-12-28 12:40:49:
1、优化,是寻找电子能量的最小点,也就是找E(SCF)的最小点,该点于温度无关;
2、按理说,在溶剂中应该重新优化,但目前的溶剂化模型也非常粗糙,重新优化的也未必对,大家就都用气相优化的结果,直接在溶剂环境 ...

优化与温度无关,可是与能量有关。都说要使反应进行要加热到多少度,做单点的时候难道不用考虑温度吗?
6楼2011-12-30 11:11:07
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ldzh0531

木虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by zhangmt at 2011-12-28 12:40:49:
1、优化,是寻找电子能量的最小点,也就是找E(SCF)的最小点,该点于温度无关;
2、按理说,在溶剂中应该重新优化,但目前的溶剂化模型也非常粗糙,重新优化的也未必对,大家就都用气相优化的结果,直接在溶剂环境 ...

QST还要验证吗?按理说QST就是根据反应物和产物得到的,再进行IRC不就等于逆向跑一边吗?
8楼2012-01-05 17:46:53
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ryxiao

禁虫 (小有名气)

本帖内容被屏蔽

9楼2012-01-05 23:09:44
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ldzh0531

木虫 (小有名气)

再问个问题,同样的条件,qst跟ts谁用的时间多?
10楼2012-03-13 23:46:48
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