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溶剂效应和优化过渡态的问题
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| 溶剂效应、温度等是优化结束后加还是跟优化一起呢?另外,用qst寻找过渡态的时候,要先优化反应物和产物(反应物和产物不只一种,要先优化他们的复合物)。如果优化的反应物和产物复合物的结构不是能量最低点而是local minimum还能不能做qst的过渡态寻找呢?只是寻找过渡态。我的意思是把反应物—过渡态—产物看成一个单独的反应,只计算他们的相对能量可不可以? |
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zhangmt
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gmy1990(金币+3): 2011-12-30 19:30:50
gmy1990(金币+3): 2011-12-30 19:30:50
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能量这个词,太泛泛了。。你要清晰能量概念的范畴。。 比如说,分子内能、焓、自由能都是能量。 计算分子内能一般包括:平动、转动、振动、电子势能、电子动能、核势能等, SCF自洽的,仅仅是电子势能这一部分,它仅仅取决于电子在核外的排布方式,此项与温度无关。而opt优化的就是找这个能量的最低点,因此,opt与温度无关。 与温度有关的,是平动、转动、振动项,其中平动项还与压力有关。这些称之为热力学能。 所以,普通的opt,给出的只是电子能,就是E(SCF)这一项。 计算频率时,给出温度、压力,才能算出热力学项,同时可以算出零点能,做了校正之后,才可以给出焓、自由能等。。 单点算,如果不做频率分析,得到的依然仅仅是E(SCF),此项与温度无关。 |

7楼2011-12-30 11:25:01
xiongb123456
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