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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 菜鸟求助：如何寻找某蛋白的基因序列全长？
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zcfwtyao

木虫 (正式写手)

[求助] 菜鸟求助：如何寻找某蛋白的基因序列全长？

比如家蚕的热休克蛋白70，能找到其ORF，想做荧光定量PCR，要用全长设计引物还是用ORF设计引物？其序列全长不会找。急切求助！感激涕零！
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1楼 2012-12-03 14:15:24
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Fleaves

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zcfwtyao: 金币+3 2012-12-04 07:07:43
先去blast，找到氨基酸序列后，再找核酸序列。
再说了，实时荧光pcr越短越灵敏

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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2楼2012-12-03 23:22:50
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robert-RBT

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
zcfwtyao: 金币+3 2012-12-04 07:06:17
zcfwtyao: 金币+3 2013-01-23 17:18:02
一般根据ORF区域就可以设计荧光定量PCR引物。但如果有其它相似序列存在，最好考虑在mRNA的UTR区域设计引物，以增加特异性。知道基因名称，直接在NCBI中选择核苷酸检索，一般登陆的序列都可以检索出来。
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3楼2012-12-04 06:48:01
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