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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 已知N端5个氨基酸，求高手找到整个蛋白序列？
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lyp1001

木虫 (小有名气)

[求助] 已知N端5个氨基酸，求高手找到整个蛋白序列？ 已有1人参与

已知N端5个氨基酸，求高手找到整个蛋白序列？
N端5个氨基酸为ala-arg-val-gln-phe,整个蛋白大小为17~20KD.人源或大肠
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1楼 2012-11-26 11:23:58
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零123happy

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
看天: 金币+2, 鼓励 常来 2012-11-27 19:14:59
wizardfan: 能举例说明如果根据氨基酸设计引物吗？ 2012-11-28 07:06:04
lyp1001: 金币+1, 感谢参与 2012-12-02 16:45:28
根据这几个氨基酸设计简并引物。然后PCR看能不能P出条带。再将它进行测序翻译成蛋白序列。
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生命不息，奋斗不止。
3楼2012-11-27 17:23:12
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
lyp1001: 金币+1, 这结果我自己也知道，不过还是谢谢你！看来只能通过实验方法来确定了 2012-11-27 09:08:02
The sequence (ARVQF) is probably not long enough to do any searching. Also it seems not a tryptic peptide. Sorry, no answer from me for now unless you give more conditions.
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2楼2012-11-26 22:50:46
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冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
wizardfan: 金币+1, 谢谢参与 2012-11-28 07:05:21
lyp1001: 金币+1, 感谢参与 2012-12-02 16:45:41
理论上是不可能的，即使有被归类到同一个酶学编号的酶的基因序列被发布到GENBANK，即使你的这几个氨基酸跟它的末端完全一致，也不能保证你的这个酶序列跟它一致，因为只有变异和进化是不变的。
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流星来时我许了个愿，愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具，久不看论坛一来就提问者，宁弃EPI和VIP也不回帖。
4楼2012-11-28 06:08:00
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charliswu

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
lyp1001: 金币+1, 感谢参与 2012-12-02 16:45:54
maybe:Ubx Domain Of Human Ubxd2 Protein
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5楼2012-11-28 09:52:43
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