24小时热门版块排行榜    

查看: 4544  |  回复: 13
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

long429l

木虫 (小有名气)

[求助] MS软件有机分子三维尺寸计算

在一篇文献中看到可以通过Material Studio软件计算有机分子的三维尺寸
但计算过程写的不太详细,摸索不出来,请教高手指点
如苯分子的三维尺寸为0.341*0. 666*0. 729(单位是纳米)

2012-11-17_224314.png

[ Last edited by long429l on 2012-11-18 at 18:54 ]
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

数据处理软件 光催化 收藏 Material Studio

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

long429l

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by GTF1902 at 2012-11-19 10:02:50
先通过BUild---Crystal---rebulid Crystal 建立一个P1 晶包,也就是没有任何对称性的哪种,然后再晶包里放一个苯分子,构建是的参数设置,就用默认的10埃就好了,然后用DMOL3的最高精度优化,再优化前要在任务设置里 ...

你好,分子可以构建并优化,现在的问题是这个表示三围尺寸的a、b、c不知道怎么测量?
3楼2012-11-19 21:54:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 14 个回答

GTF1902

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2012-11-19 13:48:36
long429l: 金币+5, 有帮助 2012-11-19 21:52:05
先通过BUild---Crystal---rebulid Crystal 建立一个P1 晶包,也就是没有任何对称性的哪种,然后再晶包里放一个苯分子,构建是的参数设置,就用默认的10埃就好了,然后用DMOL3的最高精度优化,再优化前要在任务设置里面勾选上Optimize cell 选项,就可以开始优化了,希望对你有帮助
2楼2012-11-19 10:02:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chi11366

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by GTF1902 at 2012-11-19 10:02:50
先通过BUild---Crystal---rebulid Crystal 建立一个P1 晶包,也就是没有任何对称性的哪种,然后再晶包里放一个苯分子,构建是的参数设置,就用默认的10埃就好了,然后用DMOL3的最高精度优化,再优化前要在任务设置里 ...

请问一下我怎么样在一个晶胞中放入一个分子呢?是画一个晶胞,再画一个分子,然后把那个分子拉进去吗?麻烦说的详细一点点,要马上做,我软件不是很熟。一时找不到相关教程。
化工人
4楼2012-11-19 22:39:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

GTF1902

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
chaizhm: 金币+3, 谢谢~ 2012-11-20 22:04:53
long429l: 金币+5, 有帮助 2012-11-26 14:40:31
要查看尺寸,就点击右键,选择lattice  paramiter就可以了,至于怎样放就随你了,可以先做出苯分子,再通过上面步骤做个立方框,让苯分子在里面就行了,也可以先建立方框,不过这时你没法再画苯分子了,你需要重新建个xsd文件,画出苯分子,然后点击右键远复制,然后你再粘贴到立方框里。不过是不是如上图结果我不敢保证,你优化完以后,再点击右键,选择显示方式,display  stiles(具体单词对不对我不清楚,我在火车上,用的手机),然后选择CPK选项,然后分子就成胖胖的样子了,希望对你有帮助。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
5楼2012-11-20 01:02:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[论文投稿] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 5/250 2026-08-23 03:52 by OEbVnUOu01ol
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 7/350 2026-08-23 03:43 by OEbVnUOu01ol
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 6/300 2026-08-23 03:40 by OEbVnUOu01ol
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-21 9/450 2026-08-23 03:31 by OEbVnUOu01ol
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 QTy3jDtz1uLt 2026-08-21 9/450 2026-08-23 03:04 by OEbVnUOu01ol
[考博] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 DpSrDtM079iu 2026-08-22 3/150 2026-08-23 00:55 by OEbVnUOu01ol
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +7 且听虎啸 2026-08-17 8/400 2026-08-22 21:55 by 医学老男孩
[基金申请] 什么时候开奖? +7 CrisMessi 2026-08-18 8/400 2026-08-22 18:29 by 淀粉搬运工
[基金申请] 时间戳今天,20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 放榜前的不淡定 40+4 snowwithsea 2026-08-19 14/700 2026-08-21 23:51 by cratir
[基金申请] 今日不放榜?网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +16 医学老男孩 2026-08-20 20/1000 2026-08-21 21:13 by Ldrop2023
[基金申请] 让我中一个面上吧! +11 大萍1987 2026-08-20 13/650 2026-08-21 14:48 by 20120902066
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧? +4 哈哈蛤? 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[论文投稿] 投稿咨询 +5 wwm09 2026-08-17 7/350 2026-08-21 10:11 by 期刊论文帮手
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
[基金申请] 估计是周四 +3 archvillain 2026-08-18 3/150 2026-08-21 01:48 by jnhyjjm
[基金申请] 时间戳变了,能看出什么问题? +18 基诺咪客 2026-08-17 23/1150 2026-08-20 17:19 by Godzela
[基金申请] 今天放榜吗? +14 布布和一二 2026-08-19 15/750 2026-08-19 18:07 by gltch
[基金申请] 朋友圈看到的 +6 wangzilk 2026-08-18 8/400 2026-08-19 10:55 by Haru815
[基金申请] 明天放榜? +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
信息提示
请填处理意见