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houzile0

金虫 (小有名气)

[求助] 分子静力学计算

哪位大神有分子静力学计算的资料啊,分子静力学计算是用什么软件呢,和分子动力学有什么区别呢
ES势垒的静力学计算 我们首先对整个晶胞做弛豫,给出初始的稳定晶胞,然后把增原子放在台阶,上.静力学模拟中,晶胞原子都是自由的;对于增原子,我们在起点(台阶边缘)和终点之间,沿着扩散路径(x方向)画一条直线;从起点开始,每隔0.1ax取一个点.使增原子在每一点处的x坐标固定(这个坐标就是反应路径),而垂直于扩散路径的两个坐标(y,z坐标)则可以自由变化.这样通过MD模拟,可以得到每一个垂直于反应路径的平面上的系统的势能最小值(即系统的结合能).我们以反应路径为横坐标、系统总的势能为纵坐标做出势能曲线,即可得到增原子扩散的ES势垒.

以上这个过程是通过什么软件实现的呢
不甚感激!
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非淡泊无以明志,非宁静无以致远
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

【答案】应助回帖


月只蓝: 金币+1, 应助指数+1, 感谢指导! 2014-03-28 20:50:50
MS软件里有个功能是modify——constraints固定x、y或z坐标

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
#有问题发论坛,不接受私聊#爱晶体,爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
2楼2014-03-27 10:11:44
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houzile0

金虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by pigrass at 2014-03-27 10:11:44
MS软件里有个功能是modify——constraints固定x、y或z坐标

用分子动力学软件可以实现么,如lammps,这方面,我没有概念啊
非淡泊无以明志,非宁静无以致远
3楼2014-03-27 11:01:16
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪


月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-03-28 20:50:56
应该是叫“分子动力学中的静态结构弛豫方法”吧 所以本质上应该还是动力学模拟

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
#有问题发论坛,不接受私聊#爱晶体,爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
4楼2014-03-27 11:11:03
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houzile0

金虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by pigrass at 2014-03-27 11:11:03
应该是叫“分子动力学中的静态结构弛豫方法”吧 所以本质上应该还是动力学模拟

是这样的,那用什么软件实现呢
非淡泊无以明志,非宁静无以致远
5楼2014-03-28 14:48:37
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pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪


月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-03-28 20:51:02
引用回帖:
5楼: Originally posted by houzile0 at 2014-03-28 14:48:37
是这样的,那用什么软件实现呢...

不清楚,涉及ES的好像是lammps和蒙特卡洛吧
#有问题发论坛,不接受私聊#爱晶体,爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
6楼2014-03-28 15:19:40
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故事是这样的

新虫 (小有名气)

您好 楼主 请问您的问题最后是如何解决的呢?在下也想达到您的类似结果~~
7楼2014-12-03 21:14:10
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fulei-2009

新虫 (正式写手)

Molecular Statics Simulation 这个到底是用哪个软件模拟???求助
8楼2016-12-08 16:12:03
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