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分子静力学计算
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哪位大神有分子静力学计算的资料啊，分子静力学计算是用什么软件呢，和分子动力学有什么区别呢 ES势垒的静力学计算 我们首先对整个晶胞做弛豫,给出初始的稳定晶胞,然后把增原子放在台阶，上.静力学模拟中,晶胞原子都是自由的;对于增原子,我们在起点(台阶边缘)和终点之间,沿着扩散路径(x方向)画一条直线;从起点开始,每隔0.1ax取一个点.使增原子在每一点处的x坐标固定(这个坐标就是反应路径),而垂直于扩散路径的两个坐标(y,z坐标)则可以自由变化.这样通过MD模拟,可以得到每一个垂直于反应路径的平面上的系统的势能最小值(即系统的结合能).我们以反应路径为横坐标、系统总的势能为纵坐标做出势能曲线,即可得到增原子扩散的ES势垒. 以上这个过程是通过什么软件实现的呢 不甚感激！ |
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