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分子模拟的关于势函数以及初始构型的几个小问题
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1)我说的是经典分子动力学的模拟,本人采用的ME软件,想请教下比如我建模SiO2时,我用晶体结构或者随机加入Si和O离子肯定初始构型就不同了,然后我用同样的势函数以及相同的环境条件,也就是只有初始构型不同。而最后得到的结构却是差距很大,晶体的那个最后仍是基本保持;随机加入的那个则只是近程有序(一般非晶模拟采用此法)。如何理解这样的区别呢?请大家说说 2)MSD可求扩散系数,我做的MSD往往是后面平衡部分斜率基本为0,这代表什么意思,我温度设置是先高温后降温后保持恒温。 |
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