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a71840584

金虫 (正式写手)

[求助] 你们都测哪些指标

做有关植物的毒理实验,大家一般都测哪些指标呢?感觉自己测的指标好少,我测抗氧化酶系(SOD/POD/CAT),MDA,还想测个超氧阴离子(O2-),大家觉着有没有必要呢,是不是和前面哪个指标重复?另外大家给我推荐几个植物常测的方法比较成熟的指标啊.
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starseacow

专家顾问 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
a71840584: 金币+2, ★★★很有帮助 2012-11-09 23:14:40
动物的方法是否可以直接用在植物上,很难说。你的问题,很显然是叶绿体影响,这也就是为什么根做出来而叶子不行。关于活性氧迸发,测定各种活性氧和测定抗氧化酶是两个概念,不能互相替代。不同活性氧存在一定的相互转化,因为他们处于一个代谢系统内,同时,不同活性氧也有不同的信号作用,譬如我以前做过的工作显示某种次生代谢产物只受到H2O2调控,超氧和羟自由基并不影响。(当然,是否都要测定取决于你的实验目的,我以前搞次生代谢做活性氧,几个指标都测过,现在的组做活性氧,就考虑一个H2O2,照样出好文章。)
关于实验方法,我还是建议你使用别的做植物的文献上有报道的,且大家都用的方法。PNAS的方法讲得还算详细啊,有什么看不懂的?
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5楼2012-11-05 21:15:50
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starseacow

专家顾问 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
看你要解决什么问题来决定选择哪些指标,看见别人做什么,就找一堆指标测,发不出好文章的。楼主最好认真读几篇相关内容别人做的好文章,确定实验目的,在看需要哪些指标支持自己的研究。
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2楼2012-11-05 17:02:35
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starseacow

专家顾问 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
gyfgood: 金币+20, 为专家的博学与热心鼓掌! 2012-11-08 23:29:33
上一个帖子可能讲得太笼统。估计楼主是想研究某种物质处理植物造成的一系列和ROS迸发相关的反应。关于ROS工作,前一段时间我分享过一篇文章,你可以看看
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=4835328

关于测哪些指标,重点在于你要解决什么问题,指标测的再多,说明不了任何问题,那就是浪费时间精力。现在可以说几乎所有外界刺激与损伤,都会引起ROS迸发,抗氧化酶系活性变化,那么你单纯测这些东西说实话没意义,就算发文章也顶多是灌水的水平。举个好文章的例子:
Arabidopsis Nitric Oxide Synthase 1 Is Targeted to Mitochondria and Protects against Oxidative Damage and Dark-Induced Senescence
Fang-Qing Guo and Nigel M. Crawford
The Plant Cell December 2005 vol. 17 no. 12 3436-3450

这篇文章研究了线粒体NOS1对刺激的反应,以及NOS1带来的NO与ROS迸发的关系,并没有罗列一大堆各种各样抗氧化指标,而是为了证明自己的观点,认真的选取公认可信的方法,做出漂亮可信的结果。这样的工作解决问题,完整的讲了一个故事,所以可以发到顶级杂志。咱们现在做的工作离plant cell可能很遥远,但至少可以从想法和研究思路上向他们看齐。

我看过也解答过很多楼主的帖子,感觉你尝尝纠结于一些很细节的实验问题,这很可能是由于你所在实验组没有支持你的条件,可以理解,深表同情,我也愿意尽可能帮你解决这些问题。但我感觉更重要的是你需要对自己的课题有更深入和全面的思考,在研究到底怎么做某些实验之前,更重要的是明白你的课题涉及哪些内容,目前的最新研究进展是什么,有哪些问题还没有答案,自己如果要回答这些问题要怎么做等等。
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3楼2012-11-05 18:41:06
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a71840584

金虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by starseacow at 2012-11-05 18:41:06
上一个帖子可能讲得太笼统。估计楼主是想研究某种物质处理植物造成的一系列和ROS迸发相关的反应。关于ROS工作,前一段时间我分享过一篇文章,你可以看看
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=4835328

关于 ...

感谢你一直以来对我的帮助,我也发现了只要我发帖子一般都是等你来回答,感觉你挺厉害的。我的实验做的也挺纠结的,各种不会各种不明白,大学知识全白学了现在一点用不上,等于从头再来,老师给我定的课题又是我们实验室的先例,我是带头做的对我期望很大,师哥师姐不做这方面也没法帮我,更是难上加难,目前书上有的常规指标测的马马虎虎还算过关,老板就老是纠结于ROS和彗星实验上,因为他觉着这是我们实验室的特色。彗星太难了,小麦,单子叶植物,想取细胞核来做彗星,我就看过两篇文献,但一篇是培养的愈伤组织,还有一篇是直接养的小麦做的,而且作者是我以前的师哥,我现在天天联系他问,最后他都怕了,把博士论文发给我说:我真不记得当时怎么做的了你自己好好看看我的论文吧,而且一直劝我换指示生物,但是这是我们老师的国家自然基金的课题定的没法换。ROS我也了解了一些,最常用的就是DCFH-DA,而且我们实验室做动物的也是用这个方法,仪器软件啥的都准备好了,那个什么激光共聚焦显微镜我都没见过。。。,所以我研究了下他们动物的方法原理,感觉就是取线粒体再加探针最好能测荧光强度。我按这方法来试验了下,取植物线粒体再加探针测,试验阶段很成功,我以为行了,但是正式实验就出问题了,有的处理组没数据或很小,最近又试了好多次都不行,就是想不明白哪有问题,觉着是叶绿体影响了荧光强度,或者我没取到线粒体,但是以前就是这么做的。。我又用根尝试做,又有数据了,但是我前面指标全是用叶测的,这个用根测老板说不行。现在我就一直纠结于这两个指标,所以就想到了用其他指标代替。
你推荐给我的这篇文章我看过,我觉着测O2-和测SOD是重复的,测H2O2和测CAT时重复的,所以想测个总的ROS,这种想法对不对?
另外我刚看了一篇文献测拟南芥ROS就是加探针测荧光强度,不知道你看过没?The alternative oxidase lowers mitochondrial reactive oxygen
production in plant cells. DENIS P. MAXWELL*, YONG WANG*, AND LEE MCINTOSH但是文献太笼统了,我老是从文献中学不到啥。
还有一点不明白的是,我看用DCFH-DA测ROS老提到什么六孔板什么的,感觉虽然都是用DCFH-DA法测的具体步骤也是不一样的。我们都是直接提取线粒体,计算蛋白,根据蛋白量确定加的线粒体酶液量,最后再以每毫克蛋白的荧光强度表示结果来表明ROS的量。你要是感兴趣的话我可以告诉你这个方法的具体,顺便也帮我研究下这个方法,看我的思路是否可靠?我们师哥用这方法刚发了一篇文章,关于斑马鱼的,在Aquatic Toxicology上,题目是Effects of the ionic liquid [Omim]PF6 on antioxidant enzyme systems, ROS and
DNA damage in zebrafish (Danio rerio)你有兴趣可以看下。
再牛逼的肖邦也弹不出哥的忧伤。。。
4楼2012-11-05 19:50:02
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