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huangyan0517

金虫 (小有名气)

[求助] sds崩溃了,求解答

我把步骤说的详细些:
溶液都是按分子克隆实验书上配的,30%丙烯酰胺混合液(29:1),1.5mol/,ph8.8的ltris,1mol/l ph6.8tris ,用1mol/l ph6.8tris配的上样buffer,5倍电泳缓冲液(15.1g tris,94g gly,5g sds,1000ml)。
配胶的过程:
用的伯乐mini 1mm电泳版,板洗干净之后夹好,晾干,用的时候直接用
分离胶15%,灌完分离胶,用蒸馏水封闭一下,大概1cm的高度
等大概20-30分钟,倒掉水,滤纸吸干,灌浓缩胶,插梳子,再过半小时拔梳子。
样品浓度比较高,大概17mg/ml,0.01M的PB溶液,之前是用20ul一倍上样buffer混合5ul样品,煮沸1min后上样,上样每孔20ul。
电泳条件为浓缩胶20min,分离胶50分钟。样品为溶菌酶及其多聚体混合物。
图如下,左边两条为自己做的marker,第一个为bsa,第二个为bsa和溶菌酶单体混合物。

目前问题如下:
(1)拔完梳子之后,胶孔会有一层薄膜,应该是梳子和板之间不紧密,有空隙产生的,但是梳子是配套的,每次都会有样品加不进去的情况,用针挑也跳不干净,各位有没有这种情况,怎么解决的?
(2)ph8.8和6.8的ph用浓盐酸调好之后,ph还会变化,会增加0.1-0.2的ph,即使调好之后,还是没有压缩效应。
(3)胶配好之后,把板夹到电泳槽上,灌满电泳缓冲液,几乎每次第一次都会漏液,第二次就不会,操作完全一样
(4)电泳缓冲液没调过ph,上次测了一下,1倍大概8.5,
(5)样品分子质量越大,拖尾月严重。
(6)0.01m pb离子强度影响很大吗

跪求高人解答

后面两个是跑的血清样品,浓缩胶5%,分离胶10%,其他条件基本和上面一直,手机拍的,不太清楚,拜托也给分析分析。

溶菌酶浓缩液.jpg



1.JPG



2.JPG
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huangyan0517

金虫 (小有名气)

另外,跑电泳的过程中溴酚蓝是压得很细吗,我的一半都很粗,而且泳道之间会连接起来
时间在哪里,成就就在哪里
2楼2012-10-22 10:52:00
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longway102

至尊木虫 (文坛精英)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
发现两个图一样啊,是不是设置没弄好
3楼2012-10-22 11:14:25
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huangyan0517

金虫 (小有名气)

后面两个都是血清,上样都一样,一次跑了两块板
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4楼2012-10-22 12:03:06
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+3, 鼓励应助 2012-10-22 13:42:33
Tris缓冲液的pH非常重要,否则条带不sharp。调pH时加浓盐酸接近所需pH,令其冷却至室温后再慢慢用1N盐酸调。电泳液不必调pH,本身就是用的Tris-glycine缓冲体系。
胶在20分钟内凝可能有些快,一般是30-60分钟凝为宜。凝胶速度过快会造成孔径不均一。
为了减少电泳液漏的问题,可以在安装电泳装置时用1×的电泳液润湿玻璃短板和所夹电极板。
如果你觉得样品浓缩不好,可以适当加长浓缩胶,小胶大约1cm应该可以了。
感觉上样量有点大。不是说不行,但想要很sharp的条带,最好上样量减半。顺便问一下,你上样前是否对样品做了离心?
磷酸缓冲液对跑SDS胶有点影响,但10mM问题不是很大。
5楼2012-10-22 13:24:36
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huangyan0517

金虫 (小有名气)

没离心,用的200ulpcr管混匀,没有配套离心机。如果有沉淀,不是应该进不了胶吗?另外最终上样buffer一定要一倍吗?
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6楼2012-10-22 13:32:47
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-10-23 15:23:20
引用回帖:
6楼: Originally posted by huangyan0517 at 2012-10-22 13:32:47
没离心,用的200ulpcr管混匀,没有配套离心机。如果有沉淀,不是应该进不了胶吗?另外最终上样buffer一定要一倍吗?

用SDS上样buffer处理过的样品还是有一些不溶物的,较大的颗粒会堵塞凝胶孔。你可以在0.5ml或者1.5ml的EP管中做样。PCR管好像更贵吧。上样buffer最好是一倍,这样样品中的SDS、缓冲液等成分一致,各个孔道比较均一,不会出现有些道宽有些道窄。
7楼2012-10-23 08:22:05
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小木虫阿瑞

金虫 (正式写手)

搂主您好,看到您跑过血清样品的电泳,想请教您一下,您跑电泳时用的marker是多大的呀?我想用胎牛血清跑电泳,但是之前没用过电泳,也不清楚要按多大的分子量来选着 marker?谢谢您!
8楼2012-10-30 19:54:36
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李国梁

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

上样前  一定的离心  12000  2分钟
9楼2013-09-28 23:32:25
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