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blackrosie

新虫 (初入文坛)

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[求助] 如何找到所有蛋白质的AA序列

如何找到人类所有蛋白质的AA序列
我在ncbi里查找人类的蛋白质aa序列，找了60多万种，怎么把真正的PR找出来啊，谁知道有什么好的方法？
谢谢~~

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1楼 2012-10-15 21:23:59

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黑藻先生

银虫 (小有名气)

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【答案】应助回帖

没有EC号你还可以做同源比对等方法预测一下这个蛋白可能具有的功能
但是也有例外这个只能是估计

EC的确是酶学分类系统你可以去找找蛋白分类系统等不过这个一般都比较大类
试试按照这些分功能会比较号

至于你的蛋白要是分类的话还可以根据结构超家族什么的

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7楼2012-11-20 15:37:16

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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

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【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1

ftp://ftp.uniprot.org/pub/databa ... _sprot_human.dat.gz
all curated human proteins

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2楼2012-10-15 23:07:15

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blackrosie

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2楼: Originally posted by wizardfan at 2012-10-15 23:07:15
ftp://ftp.uniprot.org/pub/databases/uniprot/current_release/knowledgebase/taxonomic_divisions/uniprot_sprot_human.dat.gz
all curated human proteins

非常感谢~
能不能帮我转成fasta格式的啊

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3楼2012-10-16 14:51:26

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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

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【答案】应助回帖

引用回帖:

3楼: Originally posted by blackrosie at 2012-10-16 14:51:26
非常感谢~
能不能帮我转成fasta格式的啊...

ftp://ftp.uniprot.org/pub/databa ... omes/HUMAN.fasta.gz

Your should have the ability to do a little bit research

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blackrosie

4楼2012-10-16 16:54:27

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