应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 如何找到所有蛋白质的AA序列
71/1返回列表
查看: 1819  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

blackrosie

新虫 (初入文坛)

[求助] 如何找到所有蛋白质的AA序列

如何找到人类所有蛋白质的AA序列
我在ncbi里查找人类的蛋白质aa序列，找了60多万种，怎么把真正的PR找出来啊，谁知道有什么好的方法？
谢谢~~
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2012-10-15 21:23:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
ftp://ftp.uniprot.org/pub/databa ... _sprot_human.dat.gz
all curated human proteins
赞一下 回复此楼
2楼2012-10-15 23:07:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

blackrosie

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by wizardfan at 2012-10-15 23:07:15
ftp://ftp.uniprot.org/pub/databases/uniprot/current_release/knowledgebase/taxonomic_divisions/uniprot_sprot_human.dat.gz
all curated human proteins

非常感谢~
能不能帮我转成fasta格式的啊
赞一下 回复此楼
3楼2012-10-16 14:51:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by blackrosie at 2012-10-16 14:51:26
非常感谢~
能不能帮我转成fasta格式的啊...

ftp://ftp.uniprot.org/pub/databa ... omes/HUMAN.fasta.gz

Your should have the ability to do a little bit research
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

blackrosie
4楼2012-10-16 16:54:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

blackrosie

新虫 (初入文坛)
送鲜花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by wizardfan at 2012-10-16 16:54:27
ftp://ftp.uniprot.org/pub/databases/uniprot/current_release/knowledgebase/proteomes/HUMAN.fasta.gz

Your should have the ability to do a little bit research...

thank you very much
能否告诉我怎么样分类啊？比如按照功能？
赞一下 回复此楼
5楼2012-10-16 22:36:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

黑藻先生

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
wizardfan: 金币+2, 鼓励发帖交流，不过不是所有蛋白质都是酶吧，那就没有EC号了。 2012-11-20 04:40:47
可以去查EC的数据库 这个是和功能相关的
如果是有结构的可以查PDB数据库
没有结构的也有很多
比如如果是糖苷水解酶可以去CAZy数据库
不知道你具体是什么的
赞一下 回复此楼
6楼2012-11-19 15:34:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

黑藻先生

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

没有EC号 你还可以做同源比对等方法预测一下这个蛋白可能具有的功能
但是也有例外 这个只能是估计

EC的确是酶学分类系统 你可以去找找蛋白分类系统等 不过这个一般都比较大类
试试按照这些分功能会比较号

至于你的蛋白要是分类的话 还可以根据结构 超家族什么的
赞一下 回复此楼
7楼2012-11-20 15:37:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 blackrosie 的主题更新
71/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高，自己申请怎么就这么难 +8 Kittylucky 2026-08-27 8/400 2026-08-27 18:33 by raiy123
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的？ +15 爱看书的可乐 2026-08-26 17/850 2026-08-27 17:25 by xxniao123
[基金申请] 基金不中，共勉 +10 eulota 2026-08-26 10/500 2026-08-27 17:23 by lqllinqiaoli
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+5) +10 晴天加油 2026-08-26 11/550 2026-08-27 16:35 by msuhlx
[文学芳草园] 梦想 +3 myrtle 2026-08-26 3/150 2026-08-27 10:01 by angelyueyi
[基金申请] 面上合作单位盖章 +3 ssyjh 2026-08-27 3/150 2026-08-27 09:59 by 阿拉贡aragon
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 LIbGuocjEEYw 2026-08-26 4/200 2026-08-27 02:01 by Ie9AyIAvGbvs
[基金申请] 我不理解！ +15 Edward_pc 2026-08-26 23/1150 2026-08-26 20:34 by zzuzxg
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +9 炎黄贵胄 2026-08-22 10/500 2026-08-26 15:40 by semaglutide
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件，有关系吗？ +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
[基金申请] 国际合作可查了，中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候，我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
[基金申请] 人气不行了 +11 fansofjerry 2026-08-21 11/550 2026-08-25 11:04 by 孤独的英雄6
[基金申请] 我面上完蛋了 +13 且听虎啸 2026-08-20 14/700 2026-08-25 09:10 by mrkang
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +13 kulium 2026-08-21 16/800 2026-08-24 16:27 by superceng
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办？ +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧？ +4 哈哈蛤？ 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭