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crispsoft

金虫 (小有名气)

[求助] 关于G-H方法验证药效团的有效性的问题

请问有没有熟悉药效团筛选的同学,咨询一个问题:文献中提到用G-H方法验证药效团的有效性,常常从DUD网站下载数据库作为测试集。
但是该网站的很多测试集似乎是对应于特定受体的,
请问如果研究的受体不在其中,是否就不能用他们提供的诱饵测试集了?
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isus8826

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖


chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-11-11 10:38:27
药效团一般都是要做decoy 测试的  你decoy数据库中的阴性分子可以随机从数据库中选取,也可以按照构建DUB数据库的方法自己建,一般会用到指纹图谱和物理性质的相似性筛选。
2楼2012-11-10 16:49:49
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