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sunhainan666

银虫 (小有名气)

[求助] 求助如何研究一个基因的转录调控,希望大侠们给点意见和方向,新人小白什么都不懂。

小虫研究的是一个植物体内具有抗虫活性的次生代谢物合成酶,应该属于比较下游的基因的吧。

老板想让我找出这个基因受什么调控,小虫知识储备有限不知道从何下手。
目前只拿到了这个基因的启动子序列,接下去不知道该做什么了。查阅文献得知该类基因有可能受WRKY 和MYB转录因子调控当然也会受其他转录因子的影响。
请问我怎么才能拿到与之作用的转录因子,怎么确定转录因子与启动子的结合区域。小虫不胜感激。
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克隆大虾

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
有些软件可以分析预测转录因子与启动子的结合区域..你的植物材料全基因组序列已知的话,相对容易开展工作..
2楼2012-10-13 13:23:24
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