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JSZHJderek

新虫 (初入文坛)

[求助] 求助qPCR数据分析

求教各位,我用qPCR做了不同品种间A基因的相对表达量分析,老师让我做品种间显著性分析,我用Origin8.0做,但稀里糊涂啊,哪位好心人详细指导一下,不胜感激啊!!!
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219308

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★
yqbter: 金币+1, 鼓励老虫发帖! 2012-10-17 13:28:21
用内参还是参照啊?内参的话  德尔塔 德尔塔 CT 对照的话 直接比值
2楼2012-10-17 12:27:54
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yanzimeng1

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
wizardfan: 金币+2, 谢谢参与 2012-10-20 07:56:15
不管什么做的,出来的数据处理都是一样的道理。你首先要再诸多品种中选择一个品种作为对照。我举个例子,你看看就明白了。例如:
                 CT---  A基因(你的目标基因),  CT--- B基因(内参基因)
品种1(对照)    15.0                                    16.5
品种2(处理)    12.0                                                          15.9
德尔塔 CT (对照)=15.0-16.5=-1.5
德尔塔 CT (处理)=12.0-15.9=-3.9
德尔塔 德尔塔 CT  = 德尔塔 CT (处理)-德尔塔 CT (对照)=-3.9+1.5=-2.4
2的(负德尔塔 德尔塔 CT ---指数)=5.3
那么处理样品中A基因的表达量比对照的高5.3倍。

至于表达差异显不显著,每个数据都有相应的SD,也就是误差,你就利用倍数和标准误做个T测验,分析一下就可以了。
应该清楚了吧,希望对你有帮助。
3楼2012-10-19 21:27:38
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