24小时热门版块排行榜

返回列表

当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

li_shuangyan

银虫 (小有名气)

应助: 1 (幼儿园)
金币: 741.1
散金: 17
红花: 1
帖子: 64
在线: 142.6小时
虫号: 1623619
注册: 2012-02-17
专业: 理论和计算化学

[求助] 50金币寻找过渡态求助，请高手们指点

这个机理很简单，就是把圆环上的N原子及它附带的硝基，往八元环平面的上方或者下方走就行了。
有四个构型，分别是船型alpha，椅型beta，船船型BB，船椅型BC。现在寻找这四个构型相互之间的过渡态，用qst2算出虚频太小。现在打算用opt(modredundant),但实在是不知道应该扫描哪一个二面角，该固定哪个原子。
貌似opt（modredundant）时，还要看分子输入部分哪些原子随着哪些来变，有可能还要改一些原子顺序。真被他们搞的头大了。
构型在所附截图和gjf文件中，请高手们帮忙看看如何调整，小女子万分感激！

alpha.jpg

BB.jpg

BC.jpg

BETA.jpg

[ Last edited by li_shuangyan on 2012-10-9 at 11:04 ]

回复此楼

» 本帖附件资源列表

欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com
附件 1 : 4个gjf.rar

2012-10-09 10:57:29, 3.72 K

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

催化与分子模拟

» 猜你喜欢

PbS量子点如何确定浓度已经有11人回复
细胞培养，这22个细节一定要注意！（一）已经有0人回复
物理化学论文润色/翻译怎么收费? 已经有297人回复
CSC访学博后项目获批，外方学校暂停合作该怎么办？已经有51人回复
大湾区大学刘天辉课题组招收2026级博士生（与中山大学物理学院联合培养）已经有22人回复
PbS量子点紫外吸收已经有0人回复
求标准卡片Cu0.4In0.4Zn1.2S2 PDF#32-0340 已经有2人回复
比利时鲁汶大学与国家留学基金委共同资助博士研究生CSC-KU Leuven PhD Scholarship 已经有0人回复
量子点电致发光器件（QLED）：蓝光量子点（QDs）和纳米氧化锌电子传输材料已经有0人回复
需要一个圆偏振光诱导化学反应，请问使用圆偏振光作为光源，应该需要哪些设备搭建已经有0人回复
伦敦大学学院Benjamin Moss博士招收人工智能、原位光谱、催化相关26年博士生已经有11人回复

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

【求助】MS中有关于优化，计算过渡态的各个参数设定方式以及意思是什么啊？请高手指点已经有28人回复
【求助】请问用什么表征手段可以确定我这个物质结构,请高手指点，高金悬赏！已经有20人回复
【求助】(悬赏50金币)请教几个高化问题已经有20人回复

1楼 2012-10-09 11:01:33

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

li_shuangyan

银虫 (小有名气)

应助: 1 (幼儿园)
金币: 741.1
散金: 17
红花: 1
帖子: 64
在线: 142.6小时
虫号: 1623619
注册: 2012-02-17
专业: 理论和计算化学

引用回帖:

5楼: Originally posted by sesy at 2012-10-11 09:55:39
虚频有负30 40的，也有50 60的。虚频太小，跑IRC看看对不对，还有如果用qst3找的话，可能会好点，但是要求反应物产物过渡态原子序号对应，这个可以在Gview里调:Edit---Atom List---最左边是你原来的结构序号，中间是 ...

QST2时，alpha_BB与alpha_BC过渡态居然一样，IRC确认为alpha_BC的。这是不是说，alpha_BB两个构型差别太大，先从alpha经过alpha_BC的过渡态到BC,又经过一个过渡态才到了BB呀？难道有两个过渡态？或者有个什么中间体之类的？