24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 1181  |  回复: 11
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

li_shuangyan

银虫 (小有名气)

[求助] 50金币 寻找过渡态求助,请高手们指点

这个机理很简单,就是把圆环上的N原子及它附带的硝基,往八元环平面的上方或者下方走就行了。
有四个构型,分别是船型alpha,椅型beta,船船型BB,船椅型BC。现在寻找这四个构型相互之间的过渡态,用qst2算出虚频太小。现在打算用opt(modredundant),但实在是不知道应该扫描哪一个二面角,该固定哪个原子。
貌似opt(modredundant)时,还要看分子输入部分哪些原子随着哪些来变,有可能还要改一些原子顺序。真被他们搞的头大了。
构型在所附截图和gjf文件中,请高手们帮忙看看如何调整,小女子万分感激!


alpha.jpg



BB.jpg



BC.jpg



BETA.jpg

[ Last edited by li_shuangyan on 2012-10-9 at 11:04 ]
回复此楼

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : 4个gjf.rar
  • 2012-10-09 10:57:29, 3.72 K

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

催化与分子模拟

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lishijunzong

铁杆木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by li_shuangyan at 2012-10-10 12:46:34
虚频有负30 40的,也有50 60的。另外,还有beta构型和其他三个找过渡态时,QST2不能算,提示说要有3个结构来当输入。...

那你把优化好的结构上再加一幅图,最好就是移动部分在平面上的放上去,做个qst3
4楼2012-10-10 12:49:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答

lishijunzong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
li_shuangyan: 金币+2 2012-10-10 12:43:10
楼上虚频多大啊,看一下你的结构虚频应该不大
2楼2012-10-09 19:05:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

li_shuangyan

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by lishijunzong at 2012-10-09 19:05:52
楼上虚频多大啊,看一下你的结构虚频应该不大

虚频有负30 40的,也有50 60的。另外,还有beta构型和其他三个找过渡态时,QST2不能算,提示说要有3个结构来当输入。
3楼2012-10-10 12:46:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sesy

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
li_shuangyan: 金币+2 2012-10-11 12:42:50
虚频有负30 40的,也有50 60的。虚频太小,跑IRC看看对不对,还有如果用qst3找的话,可能会好点,但是要求反应物产物过渡态原子序号对应,这个可以在Gview里调:Edit---Atom List---最左边是你原来的结构序号,中间是你要改的。
Fighting!!!
5楼2012-10-11 09:55:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 材料求调剂 一志愿哈工大总分298分,前三科223分 +5 dongfang59 2026-03-27 5/250 2026-03-28 04:53 by wxiongid
[考研] 340求调剂 +5 jhx777 2026-03-27 5/250 2026-03-28 04:18 by fmesaito
[考研] 085701环境工程求调剂 +9 多久上课 2026-03-27 9/450 2026-03-28 03:58 by fmesaito
[考研] 化学调剂 +4 爱吃番茄的旭 2026-03-24 5/250 2026-03-27 17:50 by kiokin
[考研] 085600,材料与化工321分,求调剂 +9 大馋小子 2026-03-27 9/450 2026-03-27 14:30 by mmm just
[考研] 348求调剂 +4 小懒虫不懒了 2026-03-27 5/250 2026-03-27 12:47 by 果果妈咪
[考研] 求调剂323材料与化工 +7 1124361 2026-03-24 7/350 2026-03-27 10:22 by wangjy2002
[硕博家园] 北京林业大学硕导招生广告 +6 kongweilin 2026-03-26 8/400 2026-03-27 10:18 by FF_16
[考研] 一志愿武汉理工,总分321,英一数二,求老师收留。 +5 nnnnnnn5 2026-03-25 5/250 2026-03-27 04:42 by wxiongid
[考研] 071000生物学求调剂,初试成绩343 +6 小小甜面团 2026-03-25 6/300 2026-03-26 23:01 by 不吃魚的貓
[考研] 一志愿华理,数一英一285求A区调剂 +8 AZMK 2026-03-25 10/500 2026-03-26 22:37 by 学员8dgXkO
[考研] 325求调剂 +3 Aoyijiang 2026-03-23 3/150 2026-03-26 20:46 by 不吃魚的貓
[考研] 材料调剂 5+4 想要一壶桃花水 2026-03-25 10/500 2026-03-26 19:56 by 不吃魚的貓
[考研] 总分293求调剂 +6 加一一九 2026-03-25 8/400 2026-03-26 13:30 by yujianx
[考研] 化学调剂一志愿上海交通大学336分-本科上海211 +4 小鱼爱有机 2026-03-25 4/200 2026-03-26 10:19 by aa331100
[考研] 0854电子信息求调剂 +7 α____ 2026-03-22 9/450 2026-03-25 13:37 by α____
[考研] 318求调剂 +3 plum李子 2026-03-23 3/150 2026-03-25 09:42 by 雾散后相遇lc
[基金申请] 请教下大家 2026年国家基金申请是双盲审吗? +3 lishucheng1 2026-03-22 5/250 2026-03-24 08:22 by gltch
[考研] 315分,诚求调剂,材料与化工085600 +3 13756423260 2026-03-22 3/150 2026-03-22 20:11 by edmund7
[考研] 一志愿深大,0703化学,总分302,求调剂 +4 七月-七七 2026-03-21 4/200 2026-03-21 18:20 by 学员8dgXkO
信息提示
请填处理意见