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li_shuangyan银虫 (小有名气)
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[求助]
50金币 寻找过渡态求助，请高手们指点
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这个机理很简单，就是把圆环上的N原子及它附带的硝基，往八元环平面的上方或者下方走就行了。 有四个构型，分别是船型alpha，椅型beta，船船型BB，船椅型BC。现在寻找这四个构型相互之间的过渡态，用qst2算出虚频太小。现在打算用opt(modredundant),但实在是不知道应该扫描哪一个二面角，该固定哪个原子。 貌似opt（modredundant）时，还要看分子输入部分哪些原子随着哪些来变，有可能还要改一些原子顺序。真被他们搞的头大了。 构型在所附截图和gjf文件中，请高手们帮忙看看如何调整，小女子万分感激！  alpha.jpg  BB.jpg  BC.jpg  BETA.jpg [ Last edited by li_shuangyan on 2012-10-9 at 11:04 ] |
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2012-10-09 10:57:29, 3.72 K
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5楼2012-10-11 09:55:39
lishijunzong
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2楼2012-10-09 19:05:52
li_shuangyan
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3楼2012-10-10 12:46:34
lishijunzong
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4楼2012-10-10 12:49:17