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小傻孩儿

金虫 (正式写手)

[求助] 求助关于SU value及symmetry operation的两个问题。

编辑提了两个问题
1. SU value needed for the N...I distance
请问 N...I distance的SU value应该从哪里找？
2. There is pi-stacking of inversion related benzthiazoline rings.  You ought to give interplanar spacing or centroid-centroid distances, as well as the symmetry operation involved.
symmetry operation involved应该从哪方面解答呢？symmetry operation 从哪找？
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1楼 2012-09-29 18:31:58
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luxtal

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
小傻孩儿: 金币+15, ★★★很有帮助, 好，谢谢啦！ 2012-09-29 22:25:59
第一个容易，用Diamond直接量一下，距离的格式可以调整为显示（s.u.)格式。
第二个我一般是在XP里面将相应的苯环长出来，看看对应原子的编号，在用info命令显示的结果推算出对称码，也许Diamond也可以搞定，我不十分确定。
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What_we_observe_is_not_nature_itself,_but_nature_exposed_to_our_method_of_questioning----Werner_Karl_Heisenberg
2楼2012-09-29 22:19:04
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小傻孩儿

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by luxtal at 2012-09-29 22:19:04
第一个容易，用Diamond直接量一下，距离的格式可以调整为显示（s.u.)格式。
第二个我一般是在XP里面将相应的苯环长出来，看看对应原子的编号，在用info命令显示的结果推算出对称码，也许Diamond也可以搞定，我不十 ...

麻烦问一下，怎么调显示（s.u.)格式？
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3楼2012-09-29 22:37:18
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luxtal

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小傻孩儿: 金币+10, ★★★很有帮助 2012-09-30 00:19:29
你干脆把你画好的diamond图贴上来，我把你需要的信息发给你。刚才看了一下，你的第二个问题也可以用Diamond搞定，但是我需要你的CIF文件。
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小傻孩儿
What_we_observe_is_not_nature_itself,_but_nature_exposed_to_our_method_of_questioning----Werner_Karl_Heisenberg
4楼2012-09-29 22:56:22
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luxtal

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
小傻孩儿: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-09-30 00:19:21
找到了，在object，bondlable菜单里。

bondlable.JPG
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What_we_observe_is_not_nature_itself,_but_nature_exposed_to_our_method_of_questioning----Werner_Karl_Heisenberg
5楼2012-09-29 23:01:55
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小傻孩儿

金虫 (正式写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by luxtal at 2012-09-29 22:56:22
你干脆把你画好的diamond图贴上来，我把你需要的信息发给你。刚才看了一下，你的第二个问题也可以用Diamond搞定，但是我需要你的CIF文件。

cif已上传，麻烦你看看哈！
120807b.cif(25.86KB)
http://kuai.xunlei.com/d/GDFAKHJHVCIV?p=130497
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6楼2012-09-30 00:18:46
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小傻孩儿

金虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by luxtal at 2012-09-29 22:56:22
你干脆把你画好的diamond图贴上来，我把你需要的信息发给你。刚才看了一下，你的第二个问题也可以用Diamond搞定，但是我需要你的CIF文件。

我画的一个pi-pi堆积图，也许有用

Pi-Pi interaction.diamdoc(15.32KB)
http://kuai.xunlei.com/d/GXBNEMUKJXZT?p=130497
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7楼2012-09-30 00:24:16
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luxtal

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
小傻孩儿: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 辛苦了，双节快乐！ 2012-09-30 10:25:49
根据你提供的文件，I和N之间的距离是3.523（3）；两个杂环平面平行，距离为3.3998（认为有强的Pi-Pi作用），对称操作码为：-x, -y, 1-z。
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What_we_observe_is_not_nature_itself,_but_nature_exposed_to_our_method_of_questioning----Werner_Karl_Heisenberg
8楼2012-09-30 03:29:51
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