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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

[资源] 用BankIt在线向Genbank数据库提交序列

看到有人问关于使用新版bankit向Genbank数据库提交序列的问题，正好手头有一个给学生上课时用的课件，把这部分单独整理了一下，供需要的人参考。
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  • 附件 1 : 序列提交.pptx
    • 2012-09-27 08:14:59, 600.54 K

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1楼 2012-09-27 08:16:34
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萌萌李萌萌

金虫 (小有名气)
引用回帖:
22楼: Originally posted by stone2239 at 2012-12-14 14:30:21
提交序列少的话还是用bankit方便，如果有大量序列要提交那就一定要用sequin...

请问，这个序列的多少，是按照什么来区分的呢？是不同序列的多少，还是碱基对的多少？比如说，我需要提交的序列是一个病毒的全基因组序列，需要分析里面的序列组成，那直接用bankit提交的话，是不是仅仅就是一个全序列而已，没有其他的什么信息了，另外，如果我想用这个序列发文章，是不是暂时不要release？
嘿嘿，问了好多问题，因为我是新手，也一直在看这方面的材料，却越看越混乱了~麻烦楼主了~
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23楼2012-12-14 14:41:58
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alarace

至尊木虫 (知名作家)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

前两天刚上传了一个基因，不过还是感谢LZ分享哈！
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2楼2012-09-27 09:59:06
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guye1

金虫 (小有名气)
楼主好，我想问一下我的序列是对植物的某一叶绿体间隔区未作克隆而直接进行的测序，那么上传时是上传公司测序的原始序列呢还是进行序列比对剪切后的序列？如果是剪切后的序列，有一部分物种的序列是一样的，没有碱基差异了，那该怎么办，不可能就上传一条吧？谢谢
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6楼2012-10-11 07:21:54
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guye1

金虫 (小有名气)
另外就是如果直接上传原始的序列，峰图两端的部分是乱峰不够准确，在我们做分析时是要剪切去的，那么上传时到底是剪切后还是未剪切过的序列呢
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7楼2012-10-11 07:28:35
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schkk3楼
2012-09-28 17:08   回复  
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spiritdaisy4楼
2012-09-28 19:55   回复  
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lufuhao5楼
2012-09-30 16:24   回复  
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hesibonnie8楼
2012-10-29 08:56   回复  
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yituyitu9楼
2012-11-05 21:01   回复  
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小小花蕾10楼
2012-11-12 14:13   回复  
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孙盛楠12楼
2012-11-26 08:26   回复  
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fenghen36013楼
2012-12-03 18:38   回复  
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