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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 用BankIt在线向Genbank数据库提交序列
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

[资源] 用BankIt在线向Genbank数据库提交序列

看到有人问关于使用新版bankit向Genbank数据库提交序列的问题，正好手头有一个给学生上课时用的课件，把这部分单独整理了一下，供需要的人参考。
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  • 附件 1 : 序列提交.pptx
    • 2012-09-27 08:14:59, 600.54 K

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1楼 2012-09-27 08:16:34
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萌萌李萌萌

金虫 (小有名气)

★★★★★ 五星级,优秀推荐

感谢分享，请问如果我需要提交的基因序列大于50Kb,也可以直接用bankit系统吗？
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18楼2012-12-13 15:04:50
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萌萌李萌萌

金虫 (小有名气)
引用回帖:
19楼: Originally posted by stone2239 at 2012-12-13 22:28:26
可以的，Bankit只对序列的最小长度有要求，你的序列可以用bankit提交。...

谢谢，我看很多文献都是用sequin来提交，请问老师您有关于sequin如何提交的教程吗？
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20楼2012-12-14 11:07:39
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萌萌李萌萌

金虫 (小有名气)
引用回帖:
22楼: Originally posted by stone2239 at 2012-12-14 14:30:21
提交序列少的话还是用bankit方便，如果有大量序列要提交那就一定要用sequin...

请问，这个序列的多少，是按照什么来区分的呢？是不同序列的多少，还是碱基对的多少？比如说，我需要提交的序列是一个病毒的全基因组序列，需要分析里面的序列组成，那直接用bankit提交的话，是不是仅仅就是一个全序列而已，没有其他的什么信息了，另外，如果我想用这个序列发文章，是不是暂时不要release？
嘿嘿，问了好多问题，因为我是新手，也一直在看这方面的材料，却越看越混乱了~麻烦楼主了~
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23楼2012-12-14 14:41:58
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萌萌李萌萌

金虫 (小有名气)
送鲜花一朵
引用回帖:
24楼: Originally posted by stone2239 at 2012-12-14 15:06:56
1.指的是序列的数目不是碱基对多少。
2.像病毒这样的小基因组要用sequin提交，具体可参考NCBI网站给的建议，下面是网址http://www.ncbi.nlm.nih.gov/guide/howto/submit-sequence-data/
3.现在发文章都要序列号， ...

谢谢，提供了很多有效的信息~谢谢你！
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25楼2012-12-14 16:36:19
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