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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)


[资源] 用BankIt在线向Genbank数据库提交序列

看到有人问关于使用新版bankit向Genbank数据库提交序列的问题,正好手头有一个给学生上课时用的课件,把这部分单独整理了一下,供需要的人参考。
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applezhao

金虫 (小有名气)


★ 一星级,一般

你好,我是研一的新手,老板要求我学会上传基因,但是我前两天上传了一个,系统这样回复邮件,We have noticed that some or all of the sequences contain internal stop
codons and/or reading frame shifts (insertions/deletions based on BLAST
similarity search results and/or an alignment).
我问了老师,说序列肯定没问题的,让我自己找哪里出了错,实在找不到了,请帮帮忙,帮我看看我的是哪里的问题啊,谢谢啊
14楼2012-12-10 10:23:36
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alarace

至尊木虫 (知名作家)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

前两天刚上传了一个基因,不过还是感谢LZ分享哈!
2楼2012-09-27 09:59:06
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guye1

金虫 (小有名气)


楼主好,我想问一下我的序列是对植物的某一叶绿体间隔区未作克隆而直接进行的测序,那么上传时是上传公司测序的原始序列呢还是进行序列比对剪切后的序列?如果是剪切后的序列,有一部分物种的序列是一样的,没有碱基差异了,那该怎么办,不可能就上传一条吧?谢谢
6楼2012-10-11 07:21:54
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guye1

金虫 (小有名气)


另外就是如果直接上传原始的序列,峰图两端的部分是乱峰不够准确,在我们做分析时是要剪切去的,那么上传时到底是剪切后还是未剪切过的序列呢
7楼2012-10-11 07:28:35
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schkk3楼
2012-09-28 17:08   回复  
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2012-09-28 19:55   回复  
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lufuhao5楼
2012-09-30 16:24   回复  
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2012-10-29 08:56   回复  
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yituyitu9楼
2012-11-05 21:01   回复  
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孙盛楠12楼
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fenghen36013楼
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