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WSW_Alone

木虫 (著名写手)

[交流] 现在大家比对序列除了NCBI还有用哪些网站? 已有3人参与

最近看文章,除了NCBI还会去一些别的网站,比如EzBioCloud。但是我最近提交的序列比对结果两个网站却有些差异。NCBI比对的是97.00%而相同的序列在EzBioCloud却是99.43%,而且两者比对出来的菌,种名还是不一样的。
想问问大家,现在NCBI的比对结果还权威吗?或者现在除了NCBI还有哪些比对网站比较权威?

EzBioCloud.jpg



NCBI.jpg
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树2979

铁杆木虫 (正式写手)


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Eztaxon server 2.1
4楼2012-09-16 14:43:20
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dfggc

荣誉版主 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
To be, or not to be, that's a problem.
3楼2012-09-16 14:20:24
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树2979

铁杆木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
http://147.47.212.35:8080/  Eztaxon server 2.1
这个网站专门是细菌的16S rDNA的,只是这个网站的打开如果是某些学校的校园网是打不开的

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5楼2012-09-16 14:46:39
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WSW_Alone

木虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by dfggc at 2012-09-16 14:20:24
http://rdp.cme.msu.edu/

嗯,我试试。谢谢
處世樹為模,本固任從枝葉動;立身錢作樣,內方還要外邊圓。
6楼2012-09-17 22:51:44
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