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原核表达氨基酸序列
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lixilei1314
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[交流]
原核表达氨基酸序列
如题,要做原核表达,然后纯化蛋白做抗原去制备抗体。现在扩出来的序列和最开始克隆基因的时候序列相比,氨基酸有个别差异(比如250个氨基酸的序列有2个差异)。挑了几个菌去测序都是这个问题。所以想请教一下大家,这种情况会影响后面的抗体功能吗?
个人分析其他原因是:也有可能是刚开始克隆基因的时候的序列有突变的原因,也或许是个体的SNP差异吧。
想请教一下大家对这个问题的看法!
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jiangyhai
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氨基酸有差异是扩增的酶保真性不够吧。是否SNP可以再uniprot里面看的。
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2012-09-14 08:39:31
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2楼
:
Originally posted by
jiangyhai
at 2012-09-14 08:39:31
氨基酸有差异是扩增的酶保真性不够吧。是否SNP可以再uniprot里面看的。
那如果是因为扩增酶的原因,那这两个氨基酸的差异还能继续制备抗体吗?主要觉得再重新做的话,时间浪费太多了。
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3楼
2012-09-14 12:10:38
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有影响,若不是关键的氨基酸还是可以的。制备抗体的时候,主要依靠抗原表位的免疫原性来刺激产生针对该表位的抗体。但是如果测序不正确,肯定会影响你SCI的影响因子的。
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4楼
2012-09-14 13:18:24
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