24小时热门版块排行榜    

查看: 3292  |  回复: 13
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

如水.101

木虫 (小有名气)

冰洁

[求助] 径向分布函数的问题

(1)我是用Monte Carlo来计算NPT系综下体系的相平衡的,请问计算的时候需要towhee_template这个文件么?
(2)计算结束后对计算结构进行了径向分布函数分析,但是结果如下,不知是什么原因,哪位高人能给解释一下,不胜感激!
回复此楼

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : Doc2.doc
  • 2012-09-13 16:26:34, 317.5 K

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

我学习计算的一些帖子

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

勇者无惧无欲则刚
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhang_jaj

木虫 (正式写手)

想问下,是不是你把bin值调小后就和想要的图形差不多了呢?因为对你那个现象也不是非常确定。也算学习下,以后自己遇上就知道了。呵呵

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

7楼2012-09-15 20:02:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 14 个回答

zhang_jaj

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
chaizhm: 金币+3, 谢谢~ 2012-09-14 11:51:07
如水.101: 金币+2, ★有帮助 2012-09-15 08:36:13
我觉得第一个,如果你有这个分子的结构文件,那么可以用这个towhee_template来比较方便;当然你也可以直接用towhee_coords文件。

这个rdf的图,我觉得你应该说出你质疑的东西来。还有想问下,这个rdf你是用什么做出来的?它是所有每个原子对的rdf然后平均的呢,还是就某一个原子然后做出来的?

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2012-09-14 11:09:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

如水.101

木虫 (小有名气)

冰洁

送鲜花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by zhang_jaj at 2012-09-14 11:09:18
我觉得第一个,如果你有这个分子的结构文件,那么可以用这个towhee_template来比较方便;当然你也可以直接用towhee_coords文件。

这个rdf的图,我觉得你应该说出你质疑的东西来。还有想问下,这个rdf你是用什么做 ...

towhee_template中不就是给出了原子的坐标么?我计算的过程中没有采用这个文件,也没有用towhee_coords,算完后对数据处理的时候得到的径向分布函数是图中那样的,你看到这样的径向分布函数图不觉得奇怪么?这个rdf我是用towhee自带的程序来做的,它是某个原子的不是平均值。下面给出了我认为正确的rdf图,两图的差异就是我质疑的地方。
勇者无惧无欲则刚
3楼2012-09-15 08:58:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

如水.101

木虫 (小有名气)

冰洁

引用回帖:
2楼: Originally posted by zhang_jaj at 2012-09-14 11:09:18
我觉得第一个,如果你有这个分子的结构文件,那么可以用这个towhee_template来比较方便;当然你也可以直接用towhee_coords文件。

这个rdf的图,我觉得你应该说出你质疑的东西来。还有想问下,这个rdf你是用什么做 ...

towhee_template中不就是给出了原子的坐标么?我计算的过程中没有采用这个文件,也没有用towhee_coords,算完后对数据处理的时候得到的径向分布函数是图中那样的,你看到这样的径向分布函数图不觉得奇怪么?这个rdf我是用towhee自带的程序来做的,它是某个原子的不是平均值。下面给出了我认为正确的rdf图,两图的差异就是我质疑的地方。

Doc1.doc(119KB)
http://kuai.xunlei.com/d/GBWGSTAHSFHB?p=130497
勇者无惧无欲则刚
4楼2012-09-15 09:00:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[教师之家] 延安大学回应“副教授留绝笔信”:确已离世,正核实举报内容 +3 yexuqing 2026-11-04 5/250 2026-11-07 13:22 by 苏东坡二世
[公派出国] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +8 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 23/1150 2026-11-07 06:49 by Equinoxhua
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-05 7/350 2026-11-06 16:43 by 5sJFDKp2kwuI
[公派出国] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 11/550 2026-11-06 16:32 by 5sJFDKp2kwuI
[考博] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +6 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 14/700 2026-11-06 16:32 by 5sJFDKp2kwuI
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 10/500 2026-11-06 16:23 by 5sJFDKp2kwuI
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +6 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 12/600 2026-11-06 16:10 by 5sJFDKp2kwuI
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +6 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 11/550 2026-11-06 13:47 by BkA9Bi5cMhkD
[公派出国] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +8 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 12/600 2026-11-06 13:47 by BkA9Bi5cMhkD
[硕博家园] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-05 5/250 2026-11-06 09:01 by 2lRNluKrJpwL
[考研] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 14/700 2026-11-06 05:11 by qL1cU46YIdK0
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 kvewwGtKktqB 2026-11-04 14/700 2026-11-06 05:10 by qL1cU46YIdK0
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 kvewwGtKktqB 2026-11-04 11/550 2026-11-06 05:10 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 12/600 2026-11-06 04:47 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 ELBZ6WwEaRj6 2026-11-04 8/400 2026-11-06 02:24 by qL1cU46YIdK0
[考博] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 7/350 2026-11-06 02:13 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ttH3f1oA6ace 2026-11-04 9/450 2026-11-06 02:02 by qL1cU46YIdK0
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 hNpp4Y2CGvSC 2026-11-04 12/600 2026-11-06 01:53 by qL1cU46YIdK0
[考研] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +5 ncTVBM6AOJHF 2026-11-04 12/600 2026-11-06 01:42 by qL1cU46YIdK0
[基金申请] 各位基础老师们,看完中央《从严治党》的决定后,对学术界更加有信心了吧 +5 iaeyuan 2026-11-01 5/250 2026-11-04 14:43 by jinchengzi
信息提示
请填处理意见