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冰刃001

木虫 (小有名气)

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[求助] 溶剂四个水分子的氧原子无序，加不上氢。

新做一晶体，溶剂四个水分子的氧原子无序，加不上氢。残差因子为：0.820  和  -0.648， CHECK CIF 错误如下：

Alert level B
PLAT306_ALERT_2_B Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) .......       O7
PLAT306_ALERT_2_B Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) .......       O8
PLAT306_ALERT_2_B Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) .......       O9
PLAT306_ALERT_2_B Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) .......       O10
Alert level C
PLAT601_ALERT_2_C Structure Contains Solvent Accessible VOIDS of .       93 A**3

求各位老师帮忙看看，这些错误该怎么解决？或者该怎么在CIF中，或者文章中解释。

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1楼 2012-09-03 22:27:18

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

fengxue151

金虫 (小有名气)

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引用回帖:

6楼: Originally posted by beeper at 2013-04-05 19:52:51
游离水的氧上，不能理论加氢。
一定要指认O附件的q峰，然后用DFIX命令限制键长和键角。如果附近有多于两个的q峰（这基本是一定会发生的），就参考这个水可能在哪个方向会形成氢键，再指认。
一般情况下，如果晶体 ...

请问不加氢该怎么解释下呢？就说是游离水的氧吗？