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VMD中如何将两个pdb文件合成一个新的pdb文件?
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VMD中如何将两个pdb文件合成一个新的pdb文件? 例如: 若temp-1.pdb和temp-2.pdb,我想把这两个文件合成temp.pdb文件,手动和console命令流如何操作?谢谢 |
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以上方法无法得到正确的psf文件!!! #代码begin mol new temp-1.pdb ;mol addfile temp-1.psf set allsel [atomselect top all] $allsel moveby {0 0 10} $allsel set segname new $allsel writepdb temp-2.pdb ;$allsel writepsf temp-2.psf #代码end 结果对比: temp-1.psf的部分内容 1904 !NATOM 1 ADNA 1 ADE H5T HN5 0.430000 1.0080 0 2 ADNA 1 ADE O5' ON5 -0.660000 15.9994 0 3 ADNA 1 ADE C5' CN8 0.050000 12.0110 0 temp-2.psf的部分内容,与前面不搭配. 477 !NATOM 1 new 2 DC O5' O5' 0.000000 15.9994 0 2 new 2 DC C5' C5' 0.000000 12.0107 0 3 new 2 DC C4' C4' 0.000000 12.0107 0 且后面的键长,键角,二面角都为0 . |
7楼2012-08-29 15:00:26
2楼2012-08-28 08:27:38
3楼2012-08-28 18:50:50
4楼2012-08-28 19:56:55
