24小时热门版块排行榜    

查看: 5406  |  回复: 5
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

little_lion

木虫 (小有名气)

[求助] gmx安装fftw时出现could not find mpi library for --enable-mpi

(1) 解压缩fftw,lam-mpi,gromacs源码
     tar -zxvf fftw-3.1.2.tar.gz
     tar –zxvf gromacs-3.3.1.tar.gz
     tar -zxvf lam-7.1.3.tar.gz

(2) 编译lam-mpi
     cd lam-7.1.3 ./configure --prefix=/home/lam-7.1.3 --without-fc --with-rsh="ssh-x"   
     make
     make install
     注:--without-fc是不编译mpif77,可以去掉

(3) 添加mpi环境变量
      export PATH=$PATH:/home/lam-7.1.3/bin ( append to .bashrc)

(4) 编译fftw单双精度版
     cd fftw-3.1.2
     ./configure --enable-float --enable-mpi --prefix=/home/fftw-3.1.2
按上面的步骤执行到最后一步的时候出现could not find mpi library for --enable-mpi,介是神马问题捏?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

youngfi

木虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by wangyx07 at 2012-08-29 16:31:30
我也是新手,装3.3.1也遇到这个问题,我改装gromacs4.5.5不用lam就好了

gromacs4.5.5不需要安装lam?
事情没有你想得那么简单但也没有你想得那么复杂。
5楼2013-02-26 21:19:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 6 个回答

bamboo_

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-08-28 08:35:15
你的MPI不是安装在系统位置(/usr/lib)吧。

编译fftw时可以指定MPI库的路径吗?如果可以将路径指向你所安装的MPI的lib的位置。

也可以在LD_LIBRARY_PATH中加入你所安装的MPI lib的位置
2楼2012-08-28 08:34:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

wangyx07

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
zh1987hs: 金币+1, 谢谢 2012-08-29 16:50:18
我也是新手,装3.3.1也遇到这个问题,我改装gromacs4.5.5不用lam就好了
3楼2012-08-29 16:31:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

心出发

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖


zh1987hs: 金币+1, 谢谢 2013-03-03 09:17:26
很高兴现在还有人在用我当初发的这个步骤,不过劝你还是用4.5,从速度上讲要快不少。
4楼2012-10-06 19:01:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 266求调剂 +5 阳阳哇塞 2026-03-14 9/450 2026-03-18 15:05 by stone_128
[考研] 0817 化学工程 299分求调剂 有科研经历 有二区文章 +7 rare12345 2026-03-18 7/350 2026-03-18 14:31 by laoshidan
[考研] 一志愿天津大学化学工艺专业(081702)315分求调剂 +9 yangfz 2026-03-17 9/450 2026-03-18 12:38 by 尽舜尧1
[考研] 296求调剂 +5 大口吃饭 身体健 2026-03-13 5/250 2026-03-17 21:05 by 不惑可乐
[考研] 材料工程专硕调剂 +5 204818@lcx 2026-03-17 5/250 2026-03-17 17:27 by Little-xue
[考研] 302求调剂 +4 小贾同学123 2026-03-15 8/400 2026-03-17 10:33 by 小贾同学123
[考研] [导师推荐]西南科技大学国防/材料导师推荐 +3 尖角小荷 2026-03-16 6/300 2026-03-16 23:21 by 尖角小荷
[考研] 070300化学学硕求调剂 +6 太想进步了0608 2026-03-16 6/300 2026-03-16 16:13 by kykm678
[考研] 085600调剂 +5 漾漾123sun 2026-03-12 6/300 2026-03-16 15:58 by 漾漾123sun
[考研] 求老师收留调剂 +4 jiang姜66 2026-03-14 5/250 2026-03-15 20:11 by Winj1e
[考研] 26考研一志愿中国石油大学(华东)305分求调剂 +3 嘉年新程 2026-03-15 3/150 2026-03-15 13:58 by 哈哈哈哈嘿嘿嘿
[考研] 0856专硕279求调剂 +5 加油加油!? 2026-03-15 5/250 2026-03-15 11:58 by 2020015
[考研] 080500,材料学硕302分求调剂学校 +4 初识可乐 2026-03-14 5/250 2026-03-14 21:08 by peike
[考研] 297一志愿上交085600求调剂 +5 指尖八千里 2026-03-14 5/250 2026-03-14 17:26 by a不易
[考研] 265求调剂 +4 威化饼07 2026-03-12 4/200 2026-03-14 17:23 by userper
[考研] 304求调剂 +6 Mochaaaa 2026-03-12 7/350 2026-03-13 22:18 by 星空星月
[考研] [0860]321分求调剂,ab区皆可 +4 宝贵热 2026-03-13 4/200 2026-03-13 22:01 by 星空星月
[考研] 材料301分求调剂 +5 Liyouyumairs 2026-03-12 5/250 2026-03-13 14:42 by JourneyLucky
[考研] 289求调剂 +3 李政莹 2026-03-12 3/150 2026-03-13 11:02 by 求调剂zz
[考研] 270求调剂 085600材料与化工专硕 +3 YXCT 2026-03-11 3/150 2026-03-13 10:13 by houyaoxu
信息提示
请填处理意见