应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】程序失败MPI_Allreduce: malloc failed: See malloc(3C) for details
101/1返回列表
查看: 1888  |  回复: 9
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

astrolia

禁虫 (小有名气)
本帖内容被屏蔽

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2010-11-20 12:15:04
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

souledge

专家顾问 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
sunyang1988(金币+2):谢谢交流 2010-11-21 14:12:42
malloc不是一般用来开辟内存空间的函数么……如果不是内存不足或者虚拟内存不足，就可能是MPI的进程间通信出了问题，尝试减少一个核心来运算呢？或者改用内存优先的方法计算呢？
赞一下(2人) 回复此楼
思想重于技巧，内涵重于表象
2楼2010-11-21 13:08:31
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

astrolia

禁虫 (小有名气)
本帖内容被屏蔽
3楼2010-11-22 09:44:36
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

astrolia

禁虫 (小有名气)
本帖内容被屏蔽
4楼2010-11-22 09:46:38
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

souledge

专家顾问 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+2):谢谢指教 2010-11-23 14:23:59
引用回帖:
Originally posted by astrolia at 2010-11-22 09:46:38:

不过减少一个核运算，会影响速度吧，如果所计算的规模很大，或者会不会无法运算呢？

不太习惯回复短消息，直接论坛里回复吧：
引用回帖:
你好，我的配置是4核3G的CPU和4G内存，后来因为castep计算的模型加大，内存总是掉下来，根本跑不动，于是就加了2G内存，可是貌似系统只认到4G，但是加了之后倒是可以跑，跑了一半就会出现malloc failed错误。这样的配置，如果减少核或者内存优先可以尝试么？谢谢

首先，对于使用多核计算，有个很大的好处，那就是Materials Studio是32-bit的程序，而每个32-bit的程序最多只能使用4GB内存。用MPI时，每个MPI都是一个独立的进程。
第二，虽然每个进程都最多可使用4G内存，但是必须要在操作系统的管理下，如果系统是32-bit的，这个问题就不好说了。所以更换到64-bit系统或者服务器版的系统也许会好些。
我咋感觉这不是在讨论FP，而是在讨论计算机啊……
赞一下(2人) 回复此楼
思想重于技巧，内涵重于表象
5楼2010-11-23 13:16:24
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jz1043

新虫 (初入文坛)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
ym23(金币+1):谢谢帮助 2010-11-23 20:08:12
引用回帖:
Originally posted by astrolia at 2010-11-20 12:15:04:
C:\PROGRA~1\Accelrys\MATERI~1.3\etc\Gateway\..\..\bin\castepexe_mpi.exe: Rank 0:0: MPI_Allreduce: malloc failed: See malloc(3C) for details
MPI Application rank 0 exited before MPI_Finalize() with ...

问下以前运行会不会出现这种问题？

我以前也碰到过这种情况，当时是Redhat+hpmpi，安装hpmpi的时候老出现这种问题，之后换成CentOS 5.4就没有这种问题了。
赞一下(2人) 回复此楼
6楼2010-11-23 13:28:17
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

astrolia

禁虫 (小有名气)
本帖内容被屏蔽
7楼2010-11-23 16:25:09
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

astrolia

禁虫 (小有名气)
本帖内容被屏蔽
8楼2010-11-23 16:28:13
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jz1043

新虫 (初入文坛)
★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
sunyang1988(金币+3):谢谢交流 2010-11-23 23:40:58
引用回帖:
Originally posted by astrolia at 2010-11-23 16:25:09:

有过MPI问题使得优化终止，但是具体是不是malloc问题就忘了。不过可以在终止优化的模型的基础上再进行优化，也是可以最终优化成功的。
不过Redhat+hpmpi和CentOS 5.4这两个是什么东西呢，我不明白？这种东西可 ...

看了你报错信息，你的系统是windows的。

我的情况是要在linux环境下安装Materials Studio，最开始的系统是红帽子的linux(Redhat Enterprise)，惠普的hpmpi，安装hpmpi是也是一直出现你那样的错误。之后换了操作系统，用的CentOS 5.4（linux）,问题就解决了。

你具体情况我也不了解，建议：
1.重新mpi软件
2.重新安装操作系统，和mpi，其他能不装的软件尽量不装。
赞一下(2人) 回复此楼
9楼2010-11-23 23:35:41
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

astrolia

禁虫 (小有名气)
本帖内容被屏蔽
10楼2010-11-24 10:42:56
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 astrolia 的主题更新
101/1返回列表
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[有机交流] 各位大神，目前国内有哪些比较好用的逆合成软件？ 20+3 zapen 2026-09-15 7/350 2026-09-17 16:40 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 国社科系统bug了，是不是要放榜了？ +3 kynobel 2026-09-16 3/150 2026-09-17 16:11 by 接好运婷
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 mibUvS8DDCwf 2026-09-15 3/150 2026-09-17 16:03 by 0ngsZVSCTS7z
[考研] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +4 0pYnUiPDfdnk 2026-09-14 4/200 2026-09-17 14:15 by ObVzqQQh1rrE
[找工作] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 23jxep3nCNZb 2026-09-14 3/150 2026-09-17 13:39 by ObVzqQQh1rrE
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +5 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 5/250 2026-09-17 12:05 by ObVzqQQh1rrE
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 vZfe6xYu34yj 2026-09-14 4/200 2026-09-17 05:50 by k06BKNblrGRH
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 Aj1rhIDL5ixY 2026-09-14 3/150 2026-09-17 05:14 by k06BKNblrGRH
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +4 40ms4Wlo4umh 2026-09-14 4/200 2026-09-17 04:26 by k06BKNblrGRH
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 40ms4Wlo4umh 2026-09-14 3/150 2026-09-17 04:16 by k06BKNblrGRH
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +6 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 7/350 2026-09-17 02:28 by Tql5LQhh5rLK
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 LwdutQ8HoqWP 2026-09-13 5/250 2026-09-17 02:02 by Tql5LQhh5rLK
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 6/300 2026-09-17 01:50 by Tql5LQhh5rLK
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 6/300 2026-09-16 16:00 by i3KBRD19ERkG
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 6/300 2026-09-16 14:27 by i3KBRD19ERkG
[考研] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 40ms4Wlo4umh 2026-09-14 4/200 2026-09-16 06:36 by LH5NkK5Ud4bh
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +5 LwdutQ8HoqWP 2026-09-13 5/250 2026-09-16 03:14 by DgNGHc3h5tPl
[考博] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +7 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 7/350 2026-09-16 02:35 by DgNGHc3h5tPl
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +6 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 7/350 2026-09-15 16:47 by CgyNCDVNhGVg
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 6/300 2026-09-15 05:38 by 5BDX0d0WFp7t
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭