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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】程序失败MPI_Allreduce: malloc failed: See malloc(3C) for details
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astrolia

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1楼 2010-11-20 12:15:04
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astrolia

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4楼2010-11-22 09:46:38
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souledge

专家顾问 (著名写手)
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sunyang1988(金币+2):谢谢交流 2010-11-21 14:12:42
malloc不是一般用来开辟内存空间的函数么……如果不是内存不足或者虚拟内存不足，就可能是MPI的进程间通信出了问题，尝试减少一个核心来运算呢？或者改用内存优先的方法计算呢？
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思想重于技巧，内涵重于表象
2楼2010-11-21 13:08:31
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astrolia

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3楼2010-11-22 09:44:36
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souledge

专家顾问 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
zzy870720z(金币+2):谢谢指教 2010-11-23 14:23:59
引用回帖:
Originally posted by astrolia at 2010-11-22 09:46:38:

不过减少一个核运算，会影响速度吧，如果所计算的规模很大，或者会不会无法运算呢？

不太习惯回复短消息，直接论坛里回复吧：
引用回帖:
你好，我的配置是4核3G的CPU和4G内存，后来因为castep计算的模型加大，内存总是掉下来，根本跑不动，于是就加了2G内存，可是貌似系统只认到4G，但是加了之后倒是可以跑，跑了一半就会出现malloc failed错误。这样的配置，如果减少核或者内存优先可以尝试么？谢谢

首先，对于使用多核计算，有个很大的好处，那就是Materials Studio是32-bit的程序，而每个32-bit的程序最多只能使用4GB内存。用MPI时，每个MPI都是一个独立的进程。
第二，虽然每个进程都最多可使用4G内存，但是必须要在操作系统的管理下，如果系统是32-bit的，这个问题就不好说了。所以更换到64-bit系统或者服务器版的系统也许会好些。
我咋感觉这不是在讨论FP，而是在讨论计算机啊……
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思想重于技巧，内涵重于表象
5楼2010-11-23 13:16:24
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