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邓芳

木虫 (小有名气)

木虫

[求助] 添加电荷出错

grompp -f em.mdp -c solv.gro -p topol.top -o ions.tpr
运行这句命令时,出现以下错误:
Fatal error:
Atomtype SDMSO not found
请教高手,怎样修改,进行下一步添加电荷,谢谢!!
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坚持就是胜利
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邓芳

木虫 (小有名气)

木虫

引用回帖:
2楼: Originally posted by visualization at 2012-08-26 15:56:35
错误原因是分子上有个S原子的原子类型认不出来。gmx版本,4.5以后的要写成SDmso

恩,非常感谢!
坚持就是胜利
3楼2012-08-26 19:00:20
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visualization

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-08-26 19:32:16
邓芳: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2012-08-29 08:40:01
错误原因是分子上有个S原子的原子类型认不出来。gmx版本,4.5以后的要写成SDmso
2楼2012-08-26 15:56:35
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visualization

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 邓芳 at 2012-08-26 19:00:20
恩,非常感谢!...

金币呢~~·
4楼2012-08-27 17:22:57
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邓芳

木虫 (小有名气)

木虫

引用回帖:
4楼: Originally posted by visualization at 2012-08-27 17:22:57
金币呢~~·...

我不知道是否已经给了你,不知道怎样给金币,呵呵
坚持就是胜利
5楼2012-08-28 08:45:48
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