24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 1098  |  回复: 13

邓芳

木虫 (小有名气)

木虫

[求助] 添加电荷出错

grompp -f em.mdp -c solv.gro -p topol.top -o ions.tpr
运行这句命令时,出现以下错误:
Fatal error:
Atomtype SDMSO not found
请教高手,怎样修改,进行下一步添加电荷,谢谢!!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

坚持就是胜利
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

visualization

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-08-26 19:32:16
邓芳: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2012-08-29 08:40:01
错误原因是分子上有个S原子的原子类型认不出来。gmx版本,4.5以后的要写成SDmso
2楼2012-08-26 15:56:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

邓芳

木虫 (小有名气)

木虫

引用回帖:
2楼: Originally posted by visualization at 2012-08-26 15:56:35
错误原因是分子上有个S原子的原子类型认不出来。gmx版本,4.5以后的要写成SDmso

恩,非常感谢!
坚持就是胜利
3楼2012-08-26 19:00:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

visualization

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 邓芳 at 2012-08-26 19:00:20
恩,非常感谢!...

金币呢~~·
4楼2012-08-27 17:22:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

邓芳

木虫 (小有名气)

木虫

引用回帖:
4楼: Originally posted by visualization at 2012-08-27 17:22:57
金币呢~~·...

我不知道是否已经给了你,不知道怎样给金币,呵呵
坚持就是胜利
5楼2012-08-28 08:45:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 邓芳 at 2012-08-28 08:45:48
我不知道是否已经给了你,不知道怎样给金币,呵呵...

你没有给二楼悬赏的金币
把二楼设为最佳答案
6楼2012-08-28 08:50:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

邓芳

木虫 (小有名气)

木虫

★ ★
jiaoyixiong: 金币+2, 赞,奖励一下。以后悬赏,如果有人回复而且是你需要的答案,记得给人奖励。 2012-08-29 14:29:04
引用回帖:
6楼: Originally posted by jiaoyixiong at 2012-08-28 08:50:10
你没有给二楼悬赏的金币
把二楼设为最佳答案...

呵呵,这次就已经给过了吧,
坚持就是胜利
7楼2012-08-29 08:40:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

水儿CoCo

木虫 (小有名气)


月只蓝: 金币+1, 鼓励交流! 2014-03-17 18:42:43
引用回帖:
2楼: Originally posted by visualization at 2012-08-26 15:56:35
错误原因是分子上有个S原子的原子类型认不出来。gmx版本,4.5以后的要写成SDmso

你好,我想问一下这个是在哪个文件里改啊?
8楼2014-03-15 11:57:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

邓芳

木虫 (小有名气)

木虫

★ ★ ★ ★ ★
月只蓝: 金币+5, 感谢分享研究成果! 2014-03-17 18:42:48
引用回帖:
8楼: Originally posted by 水儿CoCo at 2014-03-15 11:57:22
你好,我想问一下这个是在哪个文件里改啊?...

拓扑文件里面修改
坚持就是胜利
9楼2014-03-16 11:02:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

visualization

金虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 邓芳 at 2012-08-28 08:45:48
我不知道是否已经给了你,不知道怎样给金币,呵呵...

玩笑玩笑
10楼2014-03-16 16:56:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 邓芳 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 070300化学354求调剂 +15 101次希望 2026-03-28 15/750 2026-03-31 17:58 by jp9609
[考研] 308求调剂 +11 墨墨漠 2026-03-25 11/550 2026-03-31 17:54 by 无际的草原
[考研] 求调剂 +9 akdhjs 2026-03-31 10/500 2026-03-31 17:14 by zhyzzh
[考研] 311求调剂 +9 蓝月亮亮 2026-03-30 9/450 2026-03-31 16:32 by yedezhan
[考研] 282求调剂 不挑专业 求收留 +4 Yam. 2026-03-30 5/250 2026-03-31 14:41 by 王亮_大连医科大
[考研] 生物学 296 求调剂 +7 朵朵- 2026-03-26 9/450 2026-03-31 14:26 by jp9609
[考研] 313求调剂 +6 卖个关子吧 2026-03-31 6/300 2026-03-31 10:58 by Jaylen.
[考研] 085601一志愿中山大学深圳材料工程330求调剂 +5 pipiver 2026-03-30 5/250 2026-03-31 07:37 by JourneyLucky
[考研] 285求调剂 +6 AZMK 2026-03-29 9/450 2026-03-30 21:02 by dophin1985
[考研] 085601材料工程找调剂 +17 oatmealR 2026-03-29 18/900 2026-03-30 19:21 by Wang200018
[考研] 342求调剂 +4 加油a李zs 2026-03-26 4/200 2026-03-30 16:39 by 晶体之美
[考研] 298求调剂 +3 什么是胖头鱼 2026-03-30 5/250 2026-03-30 14:41 by 青海小西牛
[考研] 332求调剂 +6 Lyy930824@ 2026-03-29 6/300 2026-03-30 10:53 by 1172367218
[考研] 071000生物学求调剂,初试成绩343 +7 小小甜面团 2026-03-25 7/350 2026-03-28 20:25 by 唐沐儿
[考研] 压国家一区线,求导师收留,有恩必谢! +7 迷人的哈哈 2026-03-28 7/350 2026-03-28 16:47 by 催化大白
[考研] 331环境科学与工程求调剂 +3 熠然好运气 2026-03-27 3/150 2026-03-28 04:11 by fmesaito
[有机交流] 高温高压反应求助 10+4 chibby 2026-03-25 4/200 2026-03-27 21:08 by BT20230424
[考研] 一志愿上海理工能源动力(085800)310分求调剂 +3 zhangmingc 2026-03-27 4/200 2026-03-27 19:01 by 给你你注意休息
[考研] 调剂推荐 +5 清酒714 2026-03-26 6/300 2026-03-27 11:12 by 不吃魚的貓
[论文投稿] Journal of Mechanical Science and Technology +3 Russ_ss 2026-03-25 5/250 2026-03-27 10:49 by 陆小果画大饼
信息提示
请填处理意见