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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 怎么得到反应物的能量
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zhoulm338

禁虫 (初入文坛)
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过渡态计算

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1楼 2012-08-06 21:42:47
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shialchemy

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

这实际上一个比较有争议的问题。据我所知，文献中普遍应用的是分别优化A和B，然后将二者能量相加。你提到的第二种方法在物理上有它可取的地方：两个分子在反应前，应该先形成一个长程力（范德华力）作用下复合物，这个复合物的能量相对于两个分开的A和B分子要底。 但是如果你用过渡态理论计算反应速率，起决定作用的是自由能，而不是能垒。虽然复合物能量底，但相应的熵也底。根据G=H-TS, 复合物的自由能一般而言较高。所以，我们一般分别优化A和B, 取G(A)+G(B)作为反应的自由能零点。如果A和B之间有类似于氢键的作用力的化，情况就更复杂了，很有可能复合物的自由能也更底。这种情况下第二种方法更合理。
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7楼2012-08-10 07:44:36
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lishijunzong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
第二中好些，把拿到的过渡态向两边优化就可以拿到反应前体了
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zhoulm338
2楼2012-08-07 08:37:34
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zhoulm338

禁虫 (初入文坛)
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3楼2012-08-07 11:41:14
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lishijunzong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by zhoulm338 at 2012-08-07 11:41:14
这个怎么优化，向两边那不是做 Irc 分析了呢？谢谢你啦，能不能给我说的稍微详细一点呢，我现在这点搞得不明白，你再给我说一点吧，我现在过渡态找到了...多谢多谢啦...

单纯的做IRC需要很多步才能达到能量最小，可以用IRC的结果在优化就得到了~如果是原料的话就没前体，若存在能量低点就是前体了
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zhoulm338
4楼2012-08-07 17:07:22
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