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未央mercedes

新虫 (初入文坛)

[交流] cDNA链的连接、包装及转染

实验概要


本实验介绍了构建cDNA文库中的cDNA链的连接、包装及转染流程。



主要试剂


EcoRⅠ连接子试剂盒



主要设备


恒温水浴,离心机、电泳仪、电泳槽、紫外观测仪



实验步骤


1. cDNA加接头反应

   1) 按下表准备反应体系

                 10×缓冲液T4DNA连接酶  3μl

                 BSA                      3μl

                 cDNA                    2.5μl

                连接子                   1μl

               T4DNA连接酶               1μl

               加水至                   30μl

   2) 15℃保温6-18小时。

   3) 70℃加热10分钟后放置于冰浴。

2. 磷酸化反应

   1) 按下表准备反应体系

            上述1.a反应物        30μl

            T4磷酸激酶10×缓冲液 4μl

            0.1mM ATP              2μl

            T4激酶(10μ/μl)      1μl

            水                    3μl

            总体积               40μl

   2) 37℃保温30分钟。用DNA纯化柱纯化带接头的cDNA。

   3) 用1ml Sephacryl S-400装柱,TEN缓冲液平衡拄,平衡液流干后,加套管,800g5min。

   4) 上样,用1mlTEN缓冲液洗柱2次,收集洗脱液。洗脱时加套管,800g5min。

   5) 合并洗脱液。

   6) 3M NaAC和无水乙醇沉淀,干燥复溶。

3. cDNA与载体联接:

   1) 准备4个离心管,按下表加入

                                                           A   B   C   D

             载体DNA0.5ug/ul)                        2

             cDNA(10ng/ul)                      0    3  2   1

            10×T4DNA连接酶缓冲液            1

            水                                            6    3   4   5

            T4DNA连接酶                                  1

   2) 保温,室温:3小时;4℃过夜。

4. 体外包装:

   1) 从-70℃取出包装蛋白,冰浴中溶化,每管50ul。

   2) 包装蛋白混合液完全溶化后,立即加入10ul“3.a”中的连接液,轻弹管壁,轻轻混匀。

   3) 22℃(室温)放置3小时。

   4) 上述包装混合液中加入445ul的phage缓冲液和25ul氯仿,轻轻混匀,冰浴保存。(包装液4℃下可存放7天)。

5. 感染

   1) 灭菌培养皿中倒入下层LB培养基,凝固后,37℃保温。

   2) 安1:1000的比例稀释“4”中的包装混合液。

   3) 取100ul稀释液和100ul菌株(Y1090、LE392)。

   4) 取4ml熔化45℃保温的上层培养基加入到“c”中的混合液中,混匀后铺板在37℃预热的下层培养基上,37℃过夜。

6. 收集和扩增文库

构建的cDNA文库经扩增后,才能保存和进行长期筛选。本文库由λgt11作为载体而构成,因此扩增时应在大肠杆菌Y1090中进行。

   1) 过夜后的皿上挑取出现的噬菌斑,加2-3mlSM缓冲液,室温震荡2小时。4℃7000g离心30min,以除去细胞碎片,分装上清,溶解噬菌斑,4℃8000-10000g快速离心10min,以除去细胞碎片和培养基成分。

   2) 重复上步操作。

   3) 上清液转入一新管 中,如要在4℃短期保存则按1ml上清中加入20-30μl的比例加入氯仿,4℃保存;如要长期保存则应加入终浓度为7%的二甲基亚砜,于-70℃保存。以被需要时重新涂板筛选文库。

来自E V E R L A B 云端实验室
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