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jdrkna

铁虫 (小有名气)

[交流] 可以用DNA marker检测RNA的大小吗 已有3人参与

体外合成的mRNA大小为1800bp,但是通过跑普通的电泳检测,用的DNA marker,跑了15min后,RNA的带在DNA marker的1000bp附近,这是怎么回事?
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jl860822

金虫 (正式写手)


楼上已经解释的很详细了,DNA Marker只能粗略反应RNA的大小,但是由于其高级结构的存在,所以不精确
3楼2012-07-30 22:52:43
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wjswj

木虫 (正式写手)

小木虫领金币专业户

★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
amisking: 金币+2, 鼓励发帖交流问题。 2012-07-30 20:13:24
可以啊,前提是在变性电泳条件下,在变性的条件下电泳能够保证RNA的复杂二级结构全部打开,DNA的双链变单链,同时也不存在二级结构无法影响其迁移率。这样就可以标识RNA的大小了。推荐变性聚丙烯酰胺凝胶电泳+银染,可以试试。琼脂糖电泳就算了,一个结构复杂的rna在电泳的时候说不定变成什么样子,其迁移率跟碱基数没有准确关系的。
金币是赌出来的
2楼2012-07-30 15:39:27
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chenguestc

木虫 (职业作家)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
可以,但是只是粗略的检测。变性电泳包括你的样品和MARKER,是较为准确的。
4楼2012-07-31 10:18:40
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