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涛哥哥

银虫 (初入文坛)

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[交流] 最近两次的荧光定量溶解曲线有多个峰

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2012-07-26 11:43:49, 307.87 K

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1楼 2012-07-26 11:44:16

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gy313wyn

铜虫 (小有名气)

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★ ★ ★
涛哥哥(金币+1): 谢谢参与
amisking: 金币+2, 鼓励发帖交流问题。 2012-07-26 21:58:17

由于几个基因的条带比较杂乱，可能共有的原因是
（1）引物特异性不好。如果是在文献中查找的，要到NCBI里进行比对看是不是目的基因的引物序列，要注意选择影响因子较高的文章中的引物可信性较高。
（2）如果引物没啥问题，那就看退火温度。可以采用普通PCR设置不同温度梯度进行扩增后跑琼脂糖电泳看哪个温度下有条带，确定基本合适的温度
（3）RNA模板可能也有问题，看看测浓度是OD值是多少，反转录后DNA模板浓度多少，进行定量时添加量也要适当

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2楼2012-07-26 20:05:09

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涛哥哥

银虫 (初入文坛)

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2楼: Originally posted by gy313wyn at 2012-07-26 20:05:09
由于几个基因的条带比较杂乱，可能共有的原因是
（1）引物特异性不好。如果是在文献中查找的，要到NCBI里进行比对看是不是目的基因的引物序列，要注意选择影响因子较高的文章中的引物可信性较高。
（2）如果引物没 ...

我用这些引物做多态都很好的持家基因以前也有师兄做过
RNA模板的OD值确实很多不在正常范围反转录后的浓度2000左右我的图就是转录后的DNA按十倍梯度稀释后的相对标准曲线请问您的反应体系cDNA添加量是多少啊？

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3楼2012-07-27 11:01:40

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gy313wyn

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引用回帖:

3楼: Originally posted by 涛哥哥 at 2012-07-27 11:01:40
我用这些引物做多态都很好的持家基因以前也有师兄做过
RNA模板的OD值确实很多不在正常范围反转录后的浓度2000左右我的图就是转录后的DNA按十倍梯度稀释后的相对标准曲线请问您的反应体系cDNA添加量是多 ...

RNA OD260/280还是要在2左右为好
我用的机子是7300的机子 10ul体系加1ul模板模板浓度200~300

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4楼2012-07-27 14:33:24

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