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dgm1208

银虫 (小有名气)

[求助] 关于微生物新种的界定(发过新种的进)

如图,本人筛得了一些菌,这是其中一个,测了16S,提交结果显示如图,想下一步买模式菌株做DNA-DNA杂交,但是貌似相关菌株数量比较多,我就想问一下,我如果选一个区段的模式菌株,比如我选择大于等于98.616的模式菌株来做,这个发文章的时候认可吗?跪求赐教啊···
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科研路艰辛···
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qiuqu_200212

至尊木虫 (知名作家)

无助又无奈

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
微生物的新种主要是生理、形态和16S(18S)序列,不过需要广博的知识基础。
无奈又无助的天鹅,孤零零
7楼2012-07-24 08:16:12
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niyq

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
amisking: 回帖置顶 2012-07-23 21:05:00
zhang8826857: 金币+1, 鼓励交流 2012-07-24 08:57:35
dgm1208: 金币+1, ★★★很有帮助 2012-08-06 18:48:57
你这个首先要搞清楚哪些不同编号的菌株是不是一个东西,你的菌株不可能和这么多菌株相似度达到差异极小的程度吧,无论如何编号你的拿到那些菌株所代表的一个种就行,最好是模式菌株,不需要那么多,但相反,如果这些相似菌株代表的是不同种的菌株,你最好每个种得到一个就行
2楼2012-07-23 10:59:58
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dgm1208

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by niyq at 2012-07-23 10:59:58
你这个首先要搞清楚哪些不同编号的菌株是不是一个东西,你的菌株不可能和这么多菌株相似度达到差异极小的程度吧,无论如何编号你的拿到那些菌株所代表的一个种就行,最好是模式菌株,不需要那么多,但相反,如果这些 ...

每一个编号都是链霉菌,但是是不同的属啊。肿么办?
科研路艰辛···
3楼2012-07-23 17:10:30
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niyq

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
amisking: 回帖置顶 2012-07-23 21:04:58
zhang8826857: 金币+1, 鼓励交流 2012-07-24 08:57:46
dgm1208: 金币+1, 有帮助 2012-08-06 18:49:08
你列的每一个编号菌株都代表不同的属吗,这就麻烦了,你的意思是说你的菌株和以上13个属的链霉菌相似,那16s在链霉菌简直就是废柴,都很难区分属,这个我还是第一次见,如果13个不都代表不同的属,那就每个属都选一个,这些恐怕还不够,还有相似的,工作量只有全测了;或者你只有在形态学上先去分辨了,再选菌株吧
4楼2012-07-23 19:45:10
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