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scnlong

木虫 (小有名气)

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[交流] 大家做生物体蛋白质模拟，结果对温度敏感么？已有4人参与

如题，大家模拟做一些如生物体酶催化的时候，改变温度会对结果有多大的影响？

假如说人体内的某一种蛋白酶，从273+37K变到273+42K蛋白酶本身会跑坍塌么？这种坍塌能否复原？

又如从273+37往低温变，然后升回来还能否恢复到原来的结构？

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1楼2012-07-18 13:28:14

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scnlong

木虫 (小有名气)

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引用回帖:

7楼: Originally posted by zmz148002989 at 2012-07-18 20:46:08
温度变化是可以跑出来的，但是需要跑的时间步长非常长才能体现出规律性的差别。对于一般的几十个ns的模拟，温度的差别基本上看不出来。如果非要去探索温度的敏感性，可以用其他的方法，如检测环境极性等来研究

Got it, thx.

还是模拟的时间太短了。就算研究，肯定也不该用一般的跑动力学的方法。