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dreamfly_ykf

木虫 (正式写手)

[求助] 水分子形成五边形判断标准

水分子由液体到冰晶体,由氢键会形成五边形或六边形,如何判断水分子间形成的是五边形还是四边形还是不定型的结构呢。例如在液体中有每个水分子的坐标值,如何判断其中有多少水分子形成五边形。

希望高手指导
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自古明王圣帝,犹须勤学,况凡庶乎!
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dreamfly_ykf

木虫 (正式写手)

我的邮箱dreamfly_ykf@163.com
谢谢

另for小蜗牛8728
三维图可以看到,但是为了分析多个轨迹文件,一个一个的数个数实在工程浩大,而且分子数多,数会出错
如果能通过编程,满足什么条件可以视为五边形,这样分析容易

看到一些文献通过拓扑进行分析,不知道有没有高手指点一下,如何入手
自古明王圣帝,犹须勤学,况凡庶乎!
7楼2012-07-17 09:58:03
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Shoney

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-07-16 16:04:52
看过一篇很老的文献,ms可以用XRD分析,lz可以看看
http://115.com/
2楼2012-07-16 09:09:58
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Shoney

木虫 (著名写手)

不知道对lz有没有帮助,突然看见lz问的是模拟的事
3楼2012-07-16 09:12:07
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dreamfly_ykf

木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by Shoney at 2012-07-16 09:12:07
不知道对lz有没有帮助,突然看见lz问的是模拟的事

怎么只是115的网页没有具体的地址和文献,请您放在附件中
自古明王圣帝,犹须勤学,况凡庶乎!
4楼2012-07-16 09:27:37
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