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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Monte Carlo » 水分子形成五边形判断标准
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dreamfly_ykf

木虫 (正式写手)

[求助] 水分子形成五边形判断标准

水分子由液体到冰晶体，由氢键会形成五边形或六边形，如何判断水分子间形成的是五边形还是四边形还是不定型的结构呢。例如在液体中有每个水分子的坐标值，如何判断其中有多少水分子形成五边形。

希望高手指导
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自古明王圣帝，犹须勤学，况凡庶乎！
1楼 2012-07-13 16:07:06
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Shoney

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-07-16 16:04:52
看过一篇很老的文献，ms可以用XRD分析，lz可以看看
http://115.com/
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2楼2012-07-16 09:09:58
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Shoney

木虫 (著名写手)
不知道对lz有没有帮助，突然看见lz问的是模拟的事
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3楼2012-07-16 09:12:07
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dreamfly_ykf

木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by Shoney at 2012-07-16 09:12:07
不知道对lz有没有帮助，突然看见lz问的是模拟的事

怎么只是115的网页没有具体的地址和文献，请您放在附件中
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自古明王圣帝，犹须勤学，况凡庶乎！
4楼2012-07-16 09:27:37
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匿名

用户注销 (正式写手)
感谢参与，应助指数 +1
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5楼2012-07-16 13:19:47
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Shoney

木虫 (著名写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by dreamfly_ykf at 2012-07-16 09:27:37
怎么只是115的网页没有具体的地址和文献，请您放在附件中...

回复的帖子ms不能上传附件，留个你的邮箱，我发给你吧
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6楼2012-07-17 09:38:13
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dreamfly_ykf

木虫 (正式写手)
我的邮箱dreamfly_ykf@163.com
谢谢

另for小蜗牛8728
三维图可以看到，但是为了分析多个轨迹文件，一个一个的数个数实在工程浩大，而且分子数多，数会出错
如果能通过编程，满足什么条件可以视为五边形，这样分析容易

看到一些文献通过拓扑进行分析，不知道有没有高手指点一下，如何入手
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自古明王圣帝，犹须勤学，况凡庶乎！
7楼2012-07-17 09:58:03
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