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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » QE(Pwscf) » 怎么利用PWSCF计算差分电荷密度
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frank_zhan

金虫 (正式写手)

[求助] 怎么利用PWSCF计算差分电荷密度

各位亲虫们，
我想计算一个体系的差分电荷密度，但是不知道过程是怎样的？比如我计算一个SWNT上修饰金原子（Au）的团簇。我想计算这两者之间的电荷转移量。理论上是利用SWNT@Au体系的总电荷密度减掉SWNT和Au团簇的电荷密度。
请求虫友们指导个详细的过程，必有重谢！
谢谢。
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frank_zhan,zy2zhan@gmail.com
1楼 2012-07-07 15:28:43
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cj4566

木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by huazhorg at 2012-07-09 12:50:28
先算SWNT@Au的电荷密度，再算SWNT@Au-Au的电荷密度，再算SWNT@Au-SWNT的电荷密度，然后用前者减去后两者。
过程：
scf1.in，->rho1.in->得到ppn1.rho
scf2.in, ->rho2.in得到ppn2.rho
scf3.in, ->r ...

你好，我不太明白最开始的三个文件，是要建三个体系分别做scf计算然后算它们的电荷密度并相减吗？下面两个图是文章上的差分电荷密度图，是不是分别对吸附体系，氧化锌表面和有机分子进行scf计算，然后算它们的电荷密度？如果这样的话，ecut和kpoint都用一样吧，望赐教，谢谢！！！

吸附图



差分电荷密度图
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8楼2012-08-23 09:35:23
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cj4566

木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by huazhorg at 2012-07-09 12:50:28
先算SWNT@Au的电荷密度，再算SWNT@Au-Au的电荷密度，再算SWNT@Au-SWNT的电荷密度，然后用前者减去后两者。
过程：
scf1.in，->rho1.in->得到ppn1.rho
scf2.in, ->rho2.in得到ppn2.rho
scf3.in, ->r ...

请问上面输入文件是用pp.x的吧，为什么我运行总是提示错误呢：
from postproc : error #         1     reading inputpp namelist
需要输入inputpp吗？
另外。filepp(1) = 'ppn1.fpl'中.fpl后缀不是必须吧，这里只是填计算电荷密度时的filplot吧。谢谢！！！
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11楼2012-08-23 13:35:35
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cj4566

木虫 (正式写手)
引用回帖:
10楼: Originally posted by frank_zhan at 2012-08-23 10:17:19
对的，但是保证这3个体系的位置不变，也就是说你可以先优化好结构，然后删掉不要的体系，比如优化好后要计算ZnO的话，可以在优化好的结构里直接删掉有机分子，对于计算有机分子，步骤是一样的，只是删掉ZnO而已。...

非常感谢！！！
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12楼2012-08-23 13:40:50
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cj4566

木虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by huazhorg at 2012-07-11 11:29:08
不用，就那样设置，这是个完整的输入文件，可以运行。...

为什么我运行不了呢？显示需要inputpp这个namelist啊啊啊啊
/
&plot
    nfile = 3
    filepp(1) = 'test01'
    filepp(2) = 'test02'
    filepp(3) = 'test03'
    weight(1) = 1.0
    weight(2) = -1.0
    weight(3) = -1.0
    iflag = 3
    output_format = 5
    fileout = 'test_diff.rho'
/
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13楼2012-08-24 07:17:06
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cj4566

木虫 (正式写手)
引用回帖:
14楼: Originally posted by souledge at 2012-08-25 05:00:43
加一句：
&inputpp
/
&plot
…
/...

谢谢souledge！
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15楼2012-08-26 08:55:57
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