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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » QE(Pwscf) » 怎么利用PWSCF计算差分电荷密度
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cj4566

木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by huazhorg at 2012-07-09 12:50:28
先算SWNT@Au的电荷密度，再算SWNT@Au-Au的电荷密度，再算SWNT@Au-SWNT的电荷密度，然后用前者减去后两者。
过程：
scf1.in，->rho1.in->得到ppn1.rho
scf2.in, ->rho2.in得到ppn2.rho
scf3.in, ->r ...

请问上面输入文件是用pp.x的吧，为什么我运行总是提示错误呢：
from postproc : error #         1     reading inputpp namelist
需要输入inputpp吗？
另外。filepp(1) = 'ppn1.fpl'中.fpl后缀不是必须吧，这里只是填计算电荷密度时的filplot吧。谢谢！！！
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11楼2012-08-23 13:35:35
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cj4566

木虫 (正式写手)
引用回帖:
10楼: Originally posted by frank_zhan at 2012-08-23 10:17:19
对的，但是保证这3个体系的位置不变，也就是说你可以先优化好结构，然后删掉不要的体系，比如优化好后要计算ZnO的话，可以在优化好的结构里直接删掉有机分子，对于计算有机分子，步骤是一样的，只是删掉ZnO而已。...

非常感谢！！！
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12楼2012-08-23 13:40:50
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cj4566

木虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by huazhorg at 2012-07-11 11:29:08
不用，就那样设置，这是个完整的输入文件，可以运行。...

为什么我运行不了呢？显示需要inputpp这个namelist啊啊啊啊
/
&plot
    nfile = 3
    filepp(1) = 'test01'
    filepp(2) = 'test02'
    filepp(3) = 'test03'
    weight(1) = 1.0
    weight(2) = -1.0
    weight(3) = -1.0
    iflag = 3
    output_format = 5
    fileout = 'test_diff.rho'
/
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13楼2012-08-24 07:17:06
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souledge

专家顾问 (著名写手)
引用回帖:
13楼: Originally posted by cj4566 at 2012-08-24 07:17:06
为什么我运行不了呢？显示需要inputpp这个namelist啊啊啊啊
/
&plot
    nfile = 3
    filepp(1) = 'test01'
    filepp(2) = 'test02'
    filepp(3) = 'test03'
    weight(1) = 1.0
    weight(2 ...

加一句：
&inputpp
/
&plot
…
/
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思想重于技巧，内涵重于表象
14楼2012-08-25 05:00:43
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cj4566

木虫 (正式写手)
引用回帖:
14楼: Originally posted by souledge at 2012-08-25 05:00:43
加一句：
&inputpp
/
&plot
…
/...

谢谢souledge！
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15楼2012-08-26 08:55:57
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naterriver

至尊木虫 (正式写手)
借楼同问，最后一步会有     from chdens : error #        incompatible celldm
/
&plot
  nfile = 3
  filepp(1) = 'cd1'
  filepp(2) = 'cd2'
  filepp(3) = 'cd3'
  weight(1) =  1.0
  weight(2) = -1.0
  weight(3) = -1.0
  iflag = 3
  output_format = 6
  fileout = 'cd.rho'
/
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16楼2012-09-05 13:39:28
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frank_zhan

金虫 (正式写手)
引用回帖:
16楼: Originally posted by naterriver at 2012-09-05 13:39:28
借楼同问，最后一步会有     from chdens : error #        incompatible celldm
/
&plot
  nfile = 3
  filepp(1) = 'cd1'
  filepp(2) = 'cd2'
  filepp(3) = 'cd3'
  weight(1) =  1.0
  weight(2)  ...

为什么用output_format=6呢？
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frank_zhan,zy2zhan@gmail.com
17楼2012-09-05 21:29:32
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naterriver

至尊木虫 (正式写手)
引用回帖:
17楼: Originally posted by frank_zhan at 2012-09-05 21:29:32
为什么用output_format=6呢？...

老板推荐让用的，5和6的差别不大吧
去PW论坛看了下可能是ibrave=0的code问题
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18楼2012-09-06 12:06:30
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frank_zhan

金虫 (正式写手)
引用回帖:
18楼: Originally posted by naterriver at 2012-09-06 12:06:30
老板推荐让用的，5和6的差别不大吧
去PW论坛看了下可能是ibrave=0的code问题...

嗯，有可能是结构设置的问题
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frank_zhan,zy2zhan@gmail.com
19楼2012-09-07 09:44:16
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joshie

新虫 (初入文坛)
还有一种差分计算方法，就是末体系电荷密度减去初始电荷密度（原子轨道的线性叠加），
关于初始电荷密度计算，保证和末状态原子位置一致，在进行scf计算，参数设置：startingwfc=‘atomtic’，代表从原子轨道出发进行简单的线性叠加。
具体可以参见 http://blog.sciencenet.cn/blog-345795-520730.html
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20楼2012-09-27 10:01:38
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